Enable cli for humanization cdr grafting
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Valutazione
- Difficoltà
- 5/5
- Tempo stimato
- Più di una settimana
- Idoneità per principianti
- 25/100
- Tipo di issue
- Funzionalità
- Chiarezza
- Abbastanza chiara
- Stato di attività
- Ferma
- Stack tecnologico
- python
- Ambito
- bioinformatics, cli
Direzione di ricerca
Inizia confrontando i percorsi web e CLI esistenti per l'umanizzazione e individua come viene attualmente esposto il grafting di CDR. Definisci il completamento come l'esecuzione del grafting di CDR tramite la CLI, con le chiamate condivise e la gestione separata di input e output descritte nell'issue funzionanti senza il browser web.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
I would like to run the tool using the cli instead of the web browser. Specifically, I saw that running the humanization using cdr grafting is not an option currently. Is this a feature you would be interested in having?
I'm happy to work on implementing this, I would propose a two step process:
- Set up the cdr grafting with as minimal changes as possible
- Make an api for the calls that are made. Currently things between the cli and the web use very similar functions for the same features in the browser and in the cli. The functions should probably be structured in a way where both of them use the same methods, but have the web interface and the cli use different methods for parsing/(de)serialising input and output. This second point would be a lot of restructuring work, but would allow the two interfaces to stay in sink more easily.
- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 267
- Fork
- 65
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
- Include un Dockerfile o un file Docker Compose
- Nessun modello di pull request
- Nessuna guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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