Hacktoberfest 2026 : les issues que les mainteneurs ont marquées pour octobre, ouvertes et accessibles aux débutants. Parcourir les issues Hacktoberfest

Merck/BioPhi

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BioPhi is an open-source antibody design platform. It features methods for automated antibody humanization (Sapiens), humanness evaluation (OASis) and an interface for computer-assisted antibody sequence design.

Merck/BioPhi est-il accessible aux débutants ?

Nous avons vu trop peu de pull requests récentes de contributeurs externes sur Merck/BioPhi pour dire à quelle fréquence elles sont fusionnées. Aucune issue accessible aux débutants n'est ouverte pour l'instant ; la liste ci-dessous montre les autres issues que nous avons pour ce dépôt.

Étoiles
268
Forks
65
Issues débutants ouvertes
0
Issues indexées
45
Langage dominant
Python
Licence
MIT
Dernier push GitHub
13/5/2025
Dernière indexation
19/9/2026
Aucun guide de contribution
Aucun code de conduite
Labels débutants
good first issue help wanted
Aucune PR mergée en 30 j

Comment contribuer à Merck/BioPhi

  1. Il n'y a pas de guide de contribution : partez du README et de quelques pull requests fusionnées récemment pour voir comment les changements sont proposés.
  2. Il fournit un Dockerfile ou un fichier Docker Compose, vous pouvez donc le lancer sans installer toute sa chaîne d'outils.
  3. Vos contributions seront publiées sous la licence MIT du projet.
  4. Suivez le dépôt pour savoir quand une nouvelle issue accessible aux débutants s'ouvre, ou parcourez les autres issues ci-dessous.
Accessible aux débutants Tout
Ouverte Toutes

Les issues sur lesquelles quelqu’un travaille peut-être déjà sont listées en dernier. Tout trier par date

  • "Tasks are waiting in queue” for several days...
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 15/100

    Merck/BioPhi#90 ·

  • Tasks are waiting in queue...
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

    Merck/BioPhi#89 · 1 commentaire ·

  • OASis local set prevalence threshold
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 57/100

    Merck/BioPhi#87 ·

  • OASis prevalence threshold for custom
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 48/100

    Merck/BioPhi#86 ·

  • bootstrap加载优化
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 35/100

    Merck/BioPhi#85 ·

  • The server is waiting indefinitely
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 15/100

    Merck/BioPhi#84 ·

  • The BioPhi server is not working
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

    Merck/BioPhi#83 ·

  • Error: [Errno 24] Too many open files: '/tmp/tmps9os6anr.fasta'
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

    Merck/BioPhi#82 · 2 commentaires ·

  • BioPhi failed with TypeError: predict_scores() got an unexpected keyword argument 'model_version'
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

    Merck/BioPhi#81 · 1 commentaire ·

  • The biophi server is not working!
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    Merck/BioPhi#80 ·

  • Cannot get image from quay.io
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    Merck/BioPhi#79 · 3 commentaires ·

  • Error: [Errno 12] Cannot allocate memory
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    Merck/BioPhi#78 · 1 commentaire ·

  • Tasks waiting in queue indefinitely
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    Merck/BioPhi#77 · 5 commentaires ·

  • Tasks are still waiting in queue... indefintiely
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    Merck/BioPhi#76 ·

  • Tasks are waiting in queue...indefinitely...not a repeat ticket
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 30/100

    Merck/BioPhi#75 ·

  • No processing occurs
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 20/100

    Merck/BioPhi#73 ·

  • Tasks are waiting in queue...indefinitely
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    Merck/BioPhi#72 ·

  • Task waiting in queue
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 30/100

    Merck/BioPhi#71 ·

  • Error when exporting Full Table from Humanization results
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 35/100

    Merck/BioPhi#68 ·

  • how to set the OASis prevalence threshold when using biophi on command line?
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

    Merck/BioPhi#66 ·

  • Simplified server installation issue
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 20/100

    Merck/BioPhi#65 ·

  • Control number of mutations when humanizing
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    Merck/BioPhi#64 ·

  • Cannot build docker
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

    Merck/BioPhi#54 ·

  • Integration of additional language models?
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    Merck/BioPhi#53 ·

  • how to get raw peptide data(sequence datasets)?
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 15/100

    Merck/BioPhi#52 ·

  • Smaller docker images
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    Merck/BioPhi#50 ·

  • Allowing humanization to make multiple outputs
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    Merck/BioPhi#47 ·

  • Enable cli for humanization cdr grafting
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    Merck/BioPhi#46 ·

  • Add mypy type checks
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

    Merck/BioPhi#45 ·

  • BioPhi failed with HMMscanError: b'Parse failed (sequence file /var/folders/j7/j8sdcdk16nn_ngnyt1nc9vlw0000gn/T/tmpuhcuvvsc.fasta):\nLine 3: illegal character }\n\n' 0it [00:00, ?it/s]
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    Merck/BioPhi#43 ·

  • Error: module 'numpy' has no attribute 'int'
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

    Merck/BioPhi#42 · 5 commentaires ·

  • Specify pandas version
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

    Merck/BioPhi#40 · 1 commentaire ·

  • Specify flask version
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 1/5 Moins d'une heure Accessibilité débutants 35/100

    Merck/BioPhi#35 ·

  • Error: Invalid sequence for "antibody"
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 25/100

    Merck/BioPhi#34 ·

  • Observation and Fix: Sqlalchemy 2.0 Compatibility - Downgrade to Sqlalchemy 1.x
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100

    Merck/BioPhi#33 · 1 réaction ·

  • Navigation arrows between individual results
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement good first issue

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

    Merck/BioPhi#15 ·

  • Enable generating multiple humanized sequence variants at once
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    Merck/BioPhi#13 ·

  • Simplify export of suggested mutations from Designer
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 20/100

    Merck/BioPhi#12 ·

  • Problems about human germline sequence
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

    Merck/BioPhi#9 · 4 commentaires ·

  • Provide instructions on mounting OASis database through Docker
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    documentation good first issue help wanted

    Difficulté 2/5 1-3 heures Accessibilité débutants 42/100

    Merck/BioPhi#8 ·

  • Implement shopping cart functionality in Designer
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 35/100

    Merck/BioPhi#5 ·

  • Humanization Benchmark Data Availability
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    question

    Difficulté 5/5 Plus d'une semaine Accessibilité débutants 25/100

    Merck/BioPhi#4 · 2 commentaires ·

  • Highlight mutations in humanization screen same as in the Designer
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 35/100

    Merck/BioPhi#3 ·

  • Implement sorting on the backend
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement good first issue help wanted

    Difficulté 3/5 1-2 jours Accessibilité débutants 45/100

    Merck/BioPhi#2 ·

  • Add number of mutations to humanization & designer panel
    Ouverte
    • Quelque chose ne va pas ?
    enhancement

    Difficulté 4/5 3-5 jours Accessibilité débutants 30/100

    Merck/BioPhi#1 ·

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