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Move chunking utilities from HDF5Array to DelayedArray?

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
5/5
Tempo stimato
Più di una settimana
Idoneità per principianti
25/100
Tipo di issue
Refactoring
Chiarezza
Da chiarire
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
r
Ambito
data

Direzione di ricerca

Inizia individuando setHDF5DumpChunkLength, setHDF5DumpChunkShape e gli helper correlati per il dimensionamento automatico dei chunk in HDF5Array, quindi confronta ciò che DelayedArray espone per il riutilizzo. Esamina le esigenze proposte di TileDBArray, DelayedRandomArray e SparseArray, usando issue #89 come contesto; il lavoro è completato quando viene concordato un design di chunking riutilizzabile che supporti questi backend.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Here I'm talking about setHDF5DumpChunkLength, setHDF5DumpChunkShape, and whatever extra functions are used to auto-choose "sensible" chunk dimensions for the HDF5 arrays. Can these be moved to DelayedArray for re-use by other backends? I would then be able to use this in TileDBArray and DelayedRandomArray, and I imagine there would also be some kind of re-use for SparseArray. In addition to making backend development easier, it could also improve efficiency by ensuring that interactions between different backends involve the same chunk dimensions. An obvious example is #89, where we could encourage consistency in chunks between the RandomNormMatrix and HDF5Matrix for optimal writing speed.

Lingua principale
R
Stelle
29
Fork
12
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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