Hacktoberfest 2026: le issue che i maintainer hanno segnato per ottobre, aperte e adatte ai principianti. Sfoglia le issue Hacktoberfest

Summation of ConstantArray of 0 with vector of 0's fails

Aperta
#123 0 commenti 0 reazioni 0 assegnatari Vedi su GitHub

Nessuno ha ancora preso questa issue.

Valutazione

Difficoltà
3/5
Tempo stimato
1-2 giorni
Idoneità per principianti
45/100
Tipo di issue
Bug
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Ferma
Stack tecnologico
r
Ambito
data

Direzione di ricerca

Riprodurre il caso con valore zero iniziando da DelayedArray::ConstantArray e dal punto di ingresso HDF5Array::writeHDF5Array, quindi confrontarlo con le combinazioni funzionanti mostrate nel report. Il lavoro è completato quando il ConstantArray di zeri più il vettore di zeri possono essere scritti correttamente, con gli esempi esistenti che fungono da controlli di regressione.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Hi,

I ran into a curious edge case, where summing a ConstantArray with a vector fails if both are zero and then writing it with HDF5Array::writeHDF5Array, but not in any other combination:

mat <- DelayedArray::ConstantArray(c(2, 4), value = 0)
res <- mat + rep(0, 2)
res
#> <2 x 4> sparse DelayedMatrix object of type "double":
#>      [,1] [,2] [,3] [,4]
#> [1,]    0    0    0    0
#> [2,]    0    0    0    0
HDF5Array::writeHDF5Array(res)
#> Error in .Arith_SVT1_v2(.Generic, e1, e2): "+" is not supported between a SparseArray object and a numeric vector
#>   (result wouldn't be sparse in general)

# All other combination seems to work
mat <- DelayedArray::ConstantArray(c(2, 4), value = 0)
res <- mat + rep(3, 2)
HDF5Array::writeHDF5Array(res)
#> <2 x 4> HDF5Matrix object of type "double":
#>      [,1] [,2] [,3] [,4]
#> [1,]    3    3    3    3
#> [2,]    3    3    3    3

mat <- DelayedArray::ConstantArray(c(2, 4), value = 17)
res <- mat + rep(0, 2)
HDF5Array::writeHDF5Array(res)
#> <2 x 4> HDF5Matrix object of type "double":
#>      [,1] [,2] [,3] [,4]
#> [1,]   17   17   17   17
#> [2,]   17   17   17   17

mat <- DelayedArray::ConstantArray(c(2, 4), value = 0)
res <- mat + 0
HDF5Array::writeHDF5Array(res)
#> <2 x 4> sparse HDF5Matrix object of type "double":
#>      [,1] [,2] [,3] [,4]
#> [1,]    0    0    0    0
#> [2,]    0    0    0    0

Created on 2025-03-05 with reprex v2.1.1

I am not actually 100% this is an DelayedArray issue or if it might rather need to be moved to HDF5Array.

Best,
Constantin

Lingua principale
R
Stelle
29
Fork
12
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

Altre issue di Bioconductor/DelayedArray

Tutte le issue di Bioconductor/DelayedArray

Issue simili

Altre issue su R

Ricevi le nuove issue nella tua casella

Un breve riepilogo di issue GitHub adatte ai principianti.