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Move chunking utilities from HDF5Array to DelayedArray?

Ouverte
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Évaluation

Difficulté
5/5
Temps estimé
Plus d'une semaine
Accessibilité débutants
25/100
Type d'issue
Refactorisation
Clarté
À clarifier
Activité
À l'abandon
Stack technique
r
Domaine
data

Piste de recherche

Commencez par localiser setHDF5DumpChunkLength, setHDF5DumpChunkShape et les helpers associés de dimensionnement automatique des chunks dans HDF5Array, puis comparez ce que DelayedArray expose pour les réutiliser. Examinez les besoins proposés de TileDBArray, DelayedRandomArray et SparseArray, avec issue #89 comme contexte ; le travail est terminé lorsqu’un design de chunking réutilisable prenant en charge ces backends est convenu.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Description

Here I'm talking about setHDF5DumpChunkLength, setHDF5DumpChunkShape, and whatever extra functions are used to auto-choose "sensible" chunk dimensions for the HDF5 arrays. Can these be moved to DelayedArray for re-use by other backends? I would then be able to use this in TileDBArray and DelayedRandomArray, and I imagine there would also be some kind of re-use for SparseArray. In addition to making backend development easier, it could also improve efficiency by ensuring that interactions between different backends involve the same chunk dimensions. An obvious example is #89, where we could encourage consistency in chunks between the RandomNormMatrix and HDF5Matrix for optimal writing speed.

Langage dominant
R
Étoiles
29
Forks
12
Aucune PR mergée en 30 j

Guide de contribution

Aucun guide de contribution indexé pour ce dépôt

Par où commencer

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