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Custom delayed operations

Aperta
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Valutazione

Difficoltà
4/5
Tempo stimato
3-5 giorni
Idoneità per principianti
45/100
Tipo di issue
Funzionalità
Chiarezza
Abbastanza chiara
Stato di attività
Tranquilla
Stack tecnologico
r
Ambito
data

Direzione di ricerca

Inizia leggendo i metodi showtree e .rec_showtree, quindi traccia il modo in cui getArrayElement gestisce le sottoclassi di DelayedOp. Riproduci l’esempio con DelayedAffineSeed e DelayedTranslateSeed, inclusa l’operazione di sottoinsieme sull’array Zarr temporaneo. Il lavoro è completato quando le classi esterne che contengono DelayedOp possono partecipare al flusso richiesto di ispezione o accesso alle operazioni ritardate senza l’errore segnalato di metodo mancante.

Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.

Descrizione

Dear @hpages,

I am working on devising lazy image transformations for https://github.com/HelenaLC/SpatialData/issues/162.

I was wondering if it is possible to use showtree or .rec_showtree methods (or similar methods) for external classes that facilitate delayed operations.

I have tried below, but it requires me to define additional methods for these classes that contain DelayedOp:

setClass(
  "DelayedAffineSeed",
  contains = "DelayedOp",
  slots = c(
    seed = "ANY",
    dim = "integer",
    dimnames = "list",
    m = "matrix",
    axes = "character",
    filter = "character",
    bg.col = "character",
    antialias = "logical",
    trace = "logical"
  )
)

setClass(
  "DelayedTranslateSeed",
  contains = "DelayedOp",
  slots = c(
    seed = "ANY",
    dim = "integer",
    dimnames = "list",
    shift = "numeric",
    axes = "character"
  )
)

# save as zarr
td <- tempfile(fileext = ".zarr")
delayed_img <- writeZarrArray(x = EBImage::imageData(img), zarr_path = td) 

# affine
rotated_delayed_img <- lazy_affine(delayed_img, m = m, filter = "bilinear")

# translate
translate_delayed_img <- lazy_translate(rotated_delayed_img, shift = c(100,200))

# subset
subset_delayed_img <- translate_delayed_img[100:200, 100:200]

> subset_delayed_img@seed
101x101 double: Subset
└─ 1024x512 double: DelayedTranslateSeed object
Error: unable to find an inherited method for function ‘getArrayElement’ for signature ‘x = "DelayedTranslateSeed"’
Lingua principale
R
Stelle
29
Fork
12
Nessuna PR unita negli ultimi 30g

Guida per i contributori

Nessuna guida per i contributori indicizzata per questo repository

Come iniziare

  1. Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
  2. Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
  3. Fai un fork del repository e lavora su un branch.
  4. Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.

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