Move chunking utilities from HDF5Array to DelayedArray?
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评估
调研方向
首先定位 HDF5Array 中的 setHDF5DumpChunkLength、setHDF5DumpChunkShape 以及相关的自动 chunk 维度 helper，然后比较 DelayedArray 提供了哪些可复用的内容。结合 issue #89 这一背景，审查 TileDBArray、DelayedRandomArray 和 SparseArray 提出的需求；当就一个支持这些后端的可复用 chunking 设计达成一致时，即视为完成。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
Here I'm talking about setHDF5DumpChunkLength, setHDF5DumpChunkShape, and whatever extra functions are used to auto-choose "sensible" chunk dimensions for the HDF5 arrays. Can these be moved to DelayedArray for re-use by other backends? I would then be able to use this in TileDBArray and DelayedRandomArray, and I imagine there would also be some kind of re-use for SparseArray. In addition to making backend development easier, it could also improve efficiency by ensuring that interactions between different backends involve the same chunk dimensions. An obvious example is #89, where we could encourage consistency in chunks between the RandomNormMatrix and HDF5Matrix for optimal writing speed.
- 主要语言
- R
- 星标
- 29
- 派生
- 12
- PR 合并指标
- 30 天内没有已合并 PR
贡献指南
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