Move chunking utilities from HDF5Array to DelayedArray?

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#93 建立於 2021年5月1日 0 則留言 0 個 reaction 已指派 0 人在 GitHub 檢視

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評估

難度: 5/5
預估耗時: 一週以上
新手友好度: 25/100

Issue 類型: 重構
描述清晰度: 需要釐清
活躍度: 停滯
技術堆疊: r
領域: data

研究方向

先定位 HDF5Array 中的 setHDF5DumpChunkLength、setHDF5DumpChunkShape 以及相關的自動 chunk 維度 helper，然後比較 DelayedArray 提供了哪些可重複使用的內容。以 issue #89 為背景，檢視 TileDBArray、DelayedRandomArray 和 SparseArray 提出的需求；當就一個支援這些後端的可重複使用 chunking 設計達成共識時，即表示完成。

由索引模型根據 Issue 內容生成。

描述

Here I'm talking about setHDF5DumpChunkLength, setHDF5DumpChunkShape, and whatever extra functions are used to auto-choose "sensible" chunk dimensions for the HDF5 arrays. Can these be moved to DelayedArray for re-use by other backends? I would then be able to use this in TileDBArray and DelayedRandomArray, and I imagine there would also be some kind of re-use for SparseArray. In addition to making backend development easier, it could also improve efficiency by ensuring that interactions between different backends involve the same chunk dimensions. An obvious example is #89, where we could encourage consistency in chunks between the RandomNormMatrix and HDF5Matrix for optimal writing speed.

主要語言: R
星號: 29
分支: 12
PR 合併指標: 30 天內沒有已合併 PR

貢獻指南

這個儲存庫沒有索引到貢獻指南

從這裡開始

先讀完整個 Issue，再讀專案的貢獻指南。
在 Issue 下留言說明你要接手 —— 這能避免兩個人做同樣的事。
Fork 儲存庫，在一個分支上完成修改。
送出 Pull Request，並在描述裡引用這個 Issue 編號。

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