predictcoding - multiple mutations at a codon are never evaluated additively
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Évaluation
- Difficulté
- 4/5
- Temps estimé
- 3-5 jours
- Accessibilité débutants
- 35/100
- Type d'issue
- Fonctionnalité
- Clarté
- Plutôt claire
- Activité
- À l'abandon
- Stack technique
- r
- Domaine
- bioinformatics
Piste de recherche
Commencez par le point d’entrée predictcoding() et reproduisez le cas de séquence HIV signalé avec trois SNPs à des positions consécutives au sein d’un codon. Suivez la manière dont REFAA et VARAA sont évalués pour ce codon, puis ajoutez une couverture pour l’avertissement demandé et vérifiez que l’avertissement apparaît lorsque les mutations ne sont pas évaluées de manière additive.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Description
I have HIV sequence data, where for three consecutive positions I have SNPS. These three all code for SNPS in the same codon.
predictcoding() returns the independently evaluated REFAA and VARAA, fine its expected behaviour. But a warning that "hey these variant amino acid mutations aren't true" would be nice!
- Langage dominant
- R
- Étoiles
- 32
- Forks
- 21
- Métriques de merge des PR
- Aucune PR mergée en 30 j
Guide de contribution
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Par où commencer
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