Hacktoberfest 2026 : les issues que les mainteneurs ont marquées pour octobre, ouvertes et accessibles aux débutants. Parcourir les issues Hacktoberfest

Conversion to dgCMatrix Causes Segmentation Fault

Ouverte
#129 11 commentaires 0 réactions 0 personnes assignées Voir sur GitHub

Personne n'a encore pris cette issue.

Évaluation

Difficulté
4/5
Temps estimé
3-5 jours
Accessibilité débutants
38/100
Type d'issue
Bug
Clarté
À clarifier
Activité
Active
Stack technique
r
Domaine
data

Piste de recherche

Aucun fichier source ni aucun test n’est indiqué. Commencez par reproduire la conversion de DelayedMatrix vers dgCMatrix avec les dimensions indiquées, puis suivez le point d’entrée de la conversion et relevez les versions pertinentes de R et du package. Le travail est terminé lorsque la conversion ne provoque plus de segfault dans ce cas et qu’un test de régression le couvre.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Description

dim(database)
    109578 2389155
class(counts(database))
    "DelayedMatrix"

After about four hours.

assay(database, "counts") <- as(assay(database, "counts"), "dgCMatrix")
     *** caught segfault ***
    address 0x7fc394337000, cause 'invalid permissions'
Langage dominant
R
Étoiles
29
Forks
12
Aucune PR mergée en 30 j

Guide de contribution

Aucun guide de contribution indexé pour ce dépôt

Par où commencer

  1. Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
  2. Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
  3. Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
  4. Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.

Autres issues de Bioconductor/DelayedArray

Toutes les issues de Bioconductor/DelayedArray

Issues similaires

Plus d'issues R

Recevez les nouvelles issues par e-mail

Un résumé court des issues GitHub adaptées aux débutants.