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Custom delayed operations

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Évaluation

Difficulté
4/5
Temps estimé
3-5 jours
Accessibilité débutants
45/100
Type d'issue
Fonctionnalité
Clarté
Plutôt claire
Activité
Calme
Stack technique
r
Domaine
data

Piste de recherche

Commencez par lire les méthodes showtree et .rec_showtree, puis suivez la manière dont getArrayElement traite les sous-classes de DelayedOp. Reproduisez l’exemple avec DelayedAffineSeed et DelayedTranslateSeed, y compris l’opération de sous-ensemble sur le tableau Zarr temporaire. C’est terminé lorsque les classes externes contenant DelayedOp peuvent participer au flux demandé d’inspection ou d’accès aux opérations différées sans l’erreur signalée de méthode manquante.

Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.

Description

Dear @hpages,

I am working on devising lazy image transformations for https://github.com/HelenaLC/SpatialData/issues/162.

I was wondering if it is possible to use showtree or .rec_showtree methods (or similar methods) for external classes that facilitate delayed operations.

I have tried below, but it requires me to define additional methods for these classes that contain DelayedOp:

setClass(
  "DelayedAffineSeed",
  contains = "DelayedOp",
  slots = c(
    seed = "ANY",
    dim = "integer",
    dimnames = "list",
    m = "matrix",
    axes = "character",
    filter = "character",
    bg.col = "character",
    antialias = "logical",
    trace = "logical"
  )
)

setClass(
  "DelayedTranslateSeed",
  contains = "DelayedOp",
  slots = c(
    seed = "ANY",
    dim = "integer",
    dimnames = "list",
    shift = "numeric",
    axes = "character"
  )
)

# save as zarr
td <- tempfile(fileext = ".zarr")
delayed_img <- writeZarrArray(x = EBImage::imageData(img), zarr_path = td) 

# affine
rotated_delayed_img <- lazy_affine(delayed_img, m = m, filter = "bilinear")

# translate
translate_delayed_img <- lazy_translate(rotated_delayed_img, shift = c(100,200))

# subset
subset_delayed_img <- translate_delayed_img[100:200, 100:200]

> subset_delayed_img@seed
101x101 double: Subset
└─ 1024x512 double: DelayedTranslateSeed object
Error: unable to find an inherited method for function ‘getArrayElement’ for signature ‘x = "DelayedTranslateSeed"’
Langage dominant
R
Étoiles
29
Forks
12
Aucune PR mergée en 30 j

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