MINFF: follow min.ff's renamed parameter files (minff 22ebd627) so the bundle can be updated
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Bewertung
- Schwierigkeit
- 4/5
- Geschätzter Aufwand
- 3-5 Tage
- Anfängerfreundlichkeit
- 48/100
Rechercherichtung
Start with scripts/minff_topology.py and inspect how it writes topol.top, then review tests/minff and tests/launch/gromacs_prepare_test.py. Reproduce the grompp failure with the newer minff layout and check how variant and O-M-O angle-constant selection are represented. Done means the tests pass with the updated bundle, and the new commit is named in the release notes.
Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.
Beschreibung
ECCE 9.3 bundles min.ff at commit d12b895b (third_party/minff). The newest minff commit, 22ebd627, renamed the parameter files (e.g. ffnonbonded_tminff_k500.itp -> ffnonbonded_tminff.itp, new forcefield_gminff.itp) and the defines that select the variant and the O-M-O angle constant. With it, grompp fails with Unknown bond_atomtype Oh and the TMINFF mineral list fails, so tests/minff does not pass and the release rule keeps the pinned commit.
To do: make scripts/minff_topology.py write topol.top for the new layout (variant and angle-constant selection), update tests/minff and tests/launch/gromacs_prepare_test.py, then bundle the new commit and name it in the release notes.
- Vorherrschende Sprache
- C
- Sterne
- 10
- Forks
- 8
- Ø Merge
- 21 Min.
- Gemergte PRs (30 T.)
- 1
Entwicklungsumgebung
Dieses Projekt bietet weder Dev-Container noch Dockerfile noch Beitragsleitfaden – die Einrichtung liegt bei Ihnen. Beginnen Sie mit der README; die allgemeinen Schritte stehen in unserem Leitfaden für den ersten Beitrag.
Erste Schritte
- Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
- Schreiben Sie ins Issue, dass Sie es übernehmen — das erspart doppelte Arbeit.
- Forken Sie das Repository und arbeiten Sie in einem Branch.
- Öffnen Sie einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.
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