MINFF: follow min.ff's renamed parameter files (minff 22ebd627) so the bundle can be updated
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Évaluation
- Difficulté
- 4/5
- Temps estimé
- 3-5 jours
- Accessibilité débutants
- 48/100
Piste de recherche
Start with scripts/minff_topology.py and inspect how it writes topol.top, then review tests/minff and tests/launch/gromacs_prepare_test.py. Reproduce the grompp failure with the newer minff layout and check how variant and O-M-O angle-constant selection are represented. Done means the tests pass with the updated bundle, and the new commit is named in the release notes.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Description
ECCE 9.3 bundles min.ff at commit d12b895b (third_party/minff). The newest minff commit, 22ebd627, renamed the parameter files (e.g. ffnonbonded_tminff_k500.itp -> ffnonbonded_tminff.itp, new forcefield_gminff.itp) and the defines that select the variant and the O-M-O angle constant. With it, grompp fails with Unknown bond_atomtype Oh and the TMINFF mineral list fails, so tests/minff does not pass and the release rule keeps the pinned commit.
To do: make scripts/minff_topology.py write topol.top for the new layout (variant and angle-constant selection), update tests/minff and tests/launch/gromacs_prepare_test.py, then bundle the new commit and name it in the release notes.
- Langage dominant
- C
- Étoiles
- 10
- Forks
- 8
- Merge moyen
- 57 min
- PR mergées (30 j)
- 2
Préparer son environnement
Ce projet ne fournit ni conteneur de développement, ni Dockerfile, ni guide de contribution : l'installation est à votre charge. Commencez par son README, et consultez notre guide de la première contribution pour les étapes générales.
Par où commencer
- Lisez l'issue en entier, puis le guide de contribution du projet.
- Signalez en commentaire que vous la prenez — cela évite que deux personnes fassent le même travail.
- Forkez le dépôt et travaillez sur une branche.
- Ouvrez une pull request qui référence le numéro de l'issue.
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