MINFF: follow min.ff's renamed parameter files (minff 22ebd627) so the bundle can be updated
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評価
調査の方向性
Start with scripts/minff_topology.py and inspect how it writes topol.top, then review tests/minff and tests/launch/gromacs_prepare_test.py. Reproduce the grompp failure with the newer minff layout and check how variant and O-M-O angle-constant selection are represented. Done means the tests pass with the updated bundle, and the new commit is named in the release notes.
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
ECCE 9.3 bundles min.ff at commit d12b895b (third_party/minff). The newest minff commit, 22ebd627, renamed the parameter files (e.g. ffnonbonded_tminff_k500.itp -> ffnonbonded_tminff.itp, new forcefield_gminff.itp) and the defines that select the variant and the O-M-O angle constant. With it, grompp fails with Unknown bond_atomtype Oh and the TMINFF mineral list fails, so tests/minff does not pass and the release rule keeps the pinned commit.
To do: make scripts/minff_topology.py write topol.top for the new layout (variant and angle-constant selection), update tests/minff and tests/launch/gromacs_prepare_test.py, then bundle the new commit and name it in the release notes.
- 主要言語
- C
- スター
- 10
- フォーク
- 8
- 平均マージ
- 21分
- マージ済み PR（30日）
- 1
環境構築
このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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