MINFF: follow min.ff's renamed parameter files (minff 22ebd627) so the bundle can be updated
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 4/5
- Thời gian dự kiến
- 3-5 ngày
- Mức phù hợp với người mới
- 48/100
Hướng nghiên cứu
Start with scripts/minff_topology.py and inspect how it writes topol.top, then review tests/minff and tests/launch/gromacs_prepare_test.py. Reproduce the grompp failure with the newer minff layout and check how variant and O-M-O angle-constant selection are represented. Done means the tests pass with the updated bundle, and the new commit is named in the release notes.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
ECCE 9.3 bundles min.ff at commit d12b895b (third_party/minff). The newest minff commit, 22ebd627, renamed the parameter files (e.g. ffnonbonded_tminff_k500.itp -> ffnonbonded_tminff.itp, new forcefield_gminff.itp) and the defines that select the variant and the O-M-O angle constant. With it, grompp fails with Unknown bond_atomtype Oh and the TMINFF mineral list fails, so tests/minff does not pass and the release rule keeps the pinned commit.
To do: make scripts/minff_topology.py write topol.top for the new layout (variant and angle-constant selection), update tests/minff and tests/launch/gromacs_prepare_test.py, then bundle the new commit and name it in the release notes.
- Ngôn ngữ chính
- C
- Star
- 10
- Fork
- 8
- Merge trung bình
- 2 giờ 34 phút
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 3
Chuẩn bị môi trường
Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của FriendsofECCE/ECCE
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 70/100
FriendsofECCE/ECCE#529 ·
-
bug
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 63/100
FriendsofECCE/ECCE#519 · 2 bình luận ·
-
bug
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 73/100
FriendsofECCE/ECCE#503 ·
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 70/100
FriendsofECCE/ECCE#336 · 1 bình luận ·
-
GROMACS Prepare: topologies for small molecules (alkanes and other organic liquids, docked ligands)Đang mởenhancement
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
FriendsofECCE/ECCE#540 ·
Tất cả issue của FriendsofECCE/ECCE
Issue tương tự
-
priority:medium type:chore
Độ khó 1/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 84/100
crazy-goat/php-fpm-ng#1041 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Test failure on FreeBSD: #26 unexpected system_clock sourceCó thể đã có người làm Có pull request liên kết đang mở hoặc đã được merge. Đang mởlow priority rt_lib tests
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 67/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 85/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
-
bug
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 85/100