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OpenSourceBrain

已索引 12 个仓库 · 在 GitHub 查看

IzhikevichModel
GitHub repository for an OSB project for model from http://izhikevich.org/publications/whichmod.htm

Jupyter Notebook · 25 个 star
AllenInstituteNeuroML
Example files to test interaction between models developed at the Allen Brain Institute and NeuroML

HTML · 17 个 star
Documentation
Updated documentation for the Open Source Brain platform using Jupyter Book

Python · 13 个 star
osb-model-validation
Tools for automated model validation in OpenSourceBrain projects

XSLT · 9 个 star
Brunel2000
Sparsely connected spiking neuron network from Brunel 2000

Python · 6 个 star
ACnet2
Primary Auditory Cortex model by Dave Beeman

XSLT · 4 个 star
PyNNShowcase
A repository for testing interactions/conversions between NeuroML & PyNN

Python · 4 个 star
NetPyNEShowcase
NetPyNE & NeuroML interactions

Python · 4 个 star
SolinasEtAl-GolgiCell
GitHub repository for an OSB project containing a cerebellar Golgi cell based on Solinas et al 2007

XSLT · 2 个 star
VogelsSprekelerEtAl2011
Network from Vogels et al, Science 2011

Python · 1 个 star
NEURONShowcase
Examples of how to convert NEURON to & from NeuroML

NMODL · 1 个 star
HindmarshRose1984
HindmarshRose 1984 cell model

Python · 0 个 star

适合新手全部

未关闭全部

Remove pin on numpy once PyNN 0.12 used 未关闭

难度 1/5 1 小时以内新手友好度 72/100

OpenSourceBrain/Brunel2000#13 · 2026年5月19日创建
Remove pin on numpy once PyNN 0.12 used 未关闭

难度 1/5 1 小时以内新手友好度 82/100

OpenSourceBrain/PyNNShowcase#12 · 2026年5月19日创建
Check Netpyne step in Guided Tour 未关闭

T: bug

OpenSourceBrain/Documentation#49 · 已指派 1 人 · 2025年7月15日创建
Investigate handling of ExplicitInputs in the NetPyNE importer 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

OpenSourceBrain/NetPyNEShowcase#13 · 2024年12月19日创建
Update autogen 未关闭

bug enhancement

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#119 · 2024年4月11日创建
Document new git-sparse-checkout usage 未关闭

C: content T: enhancement V: OSBv2

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 30/100

OpenSourceBrain/Documentation#46 · 2024年1月17日创建
Rename example from "Regular" to "Bursting" or "RegularBursting" 未关闭

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/HindmarshRose1984#11 · 1 条评论 · 2023年11月7日创建
Have a section saying "why not collab" or "why not binder"? 未关闭

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 35/100

OpenSourceBrain/Documentation#35 · 2023年7月15日创建
Make a new release 未关闭

enhancement

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#52 · 1 个 reaction · 2023年1月25日创建
Update CI to test different NEURON versions, and all available GH arches 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/NEURONShowcase#4 · 2022年10月14日创建
parse mod channel files directly to neuroml 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 15/100

OpenSourceBrain/NEURONShowcase#2 · 2 条评论 · 2022年8月25日创建
Why is the group apic used in the fitting data but not present in the cell? 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#29 · 4 条评论 · 2022年7月21日创建
Test pipeline NetPyNE-> NeuroML-> other simulators... 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 30/100

OpenSourceBrain/NetPyNEShowcase#2 · 2 个 reaction · 2022年5月10日创建
Redo FAQ document 未关闭

C: content T: enhancement V: OSBv1 V: OSBv2

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

OpenSourceBrain/Documentation#16 · 2022年1月24日创建
Add page on publication/citing OSB 未关闭

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/Documentation#15 · 2021年11月30日创建
Add omv tests on Octave, PyNN_Brian2, NEST on 3.9 (when working on GHA) 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#12 · 2021年11月29日创建
Add test on numba script 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#11 · 2021年11月29日创建
Add new page listing what standard libraries we include, and how to request others 未关闭

C: content P: low T: enhancement V: OSBv2

OpenSourceBrain/Documentation#11 · 3 条评论 · 已指派 1 人 · 2021年10月26日创建
Set up custom CSS 未关闭

C: theme P: medium T: enhancement

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/Documentation#2 · 1 条评论 · 2021年5月3日创建
Do not silently start downloading missing bits assuming installation in hard-coded default locations 未关闭

enhancement

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#74 · 2 条评论 · 2021年1月20日创建
Adding license info 未关闭

难度 2/5 1-3 小时新手友好度 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#10 · 2018年12月17日创建
Parsing included NML files 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#8 · 2017年11月11日创建
Recursive creation of directories when writing files 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#7 · 2017年11月10日创建
izhikevich2004.py failing with PyNN 0.9.0 & NEST 2.10.0 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#6 · 6 条评论 · 2017年5月31日创建
Add metadata to detailed cell models 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 45/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#5 · 2016年12月20日创建
Finalise GLIFs 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#4 · 2016年5月10日创建
Why is external concentration of ca2 1mM not 2mM? 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#8 · 4 条评论 · 2016年1月14日创建
architecture dependent backends 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#64 · 2015年11月19日创建
Correct handling of seeds 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/Brunel2000#3 · 2015年11月12日创建
Change TABLE settings for mod files to cover wider voltage range 未关闭

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#4 · 已指派 1 人 · 2015年10月27日创建
Compare mod channel implementations & NeuroML2 versions 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#3 · 2015年10月26日创建
Check neuroConstruct project simulation configurations are producing figures 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#2 · 2015年10月26日创建
Add more figures from paper to NEURON script 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#1 · 1 条评论 · 2015年10月26日创建
Check why Ca_HVA mod file doesn't use Q10 scaling 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#2 · 2015年10月7日创建
"proper" rewrite 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 20/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#54 · 2014年12月29日创建
add conda recipes for omv engines 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#53 · 2014年12月29日创建
update schemas and implement omt validation 未关闭

bug

OpenSourceBrain/osb-model-validation#42 · 已指派 1 人 · 2014年9月23日创建
serialize the tallyman 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 20/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#41 · 2014年9月22日创建
Add documentation for mep / omt elements 未关闭

难度 3/5 1-2 天新手友好度 38/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#28 · 2014年6月18日创建
Create a libNeuroML based "pure NeuroML" script to create full 48x48 network 未关闭

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/ACnet2#4 · 2014年6月17日创建
Add a Jython based script to the nC project to recreate 48x48 network 未关闭

enhancement

OpenSourceBrain/ACnet2#3 · 已指派 1 人 · 2014年6月17日创建
Add Simulation configuration to neuroConstruct project with basic network settings 未关闭

enhancement

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

OpenSourceBrain/ACnet2#2 · 1 条评论 · 2014年6月17日创建
Add support for querying info from NeuroML 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 30/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#27 · 1 条评论 · 2014年6月17日创建
add support for tagged releases 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#22 · 1 条评论 · 2014年6月3日创建
add engine version spec 未关闭

enhancement

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#7 · 2014年4月28日创建
Add bound checks for activation variables, concentrations 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#6 · 2 条评论 · 2014年4月28日创建
add frequency analyzer 未关闭

enhancement

难度 5/5 一周以上新手友好度 20/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#4 · 1 条评论 · 2014年4月23日创建
add unit parsing 未关闭

enhancement

难度 5/5 一周以上新手友好度 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#3 · 1 条评论 · 2014年4月23日创建
Make single value to scale population size 未关闭

难度 4/5 3-5 天新手友好度 35/100

OpenSourceBrain/VogelsSprekelerEtAl2011#2 · 2013年8月2日创建
Modify population specifications to define 8000 e & 2000 i 未关闭

OpenSourceBrain/VogelsSprekelerEtAl2011#1 · 2 条评论 · 已指派 1 人 · 2013年8月2日创建

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