オーナー

OpenSourceBrain

索引済みのリポジトリ 12 件 · GitHub で見る

IzhikevichModel
GitHub repository for an OSB project for model from http://izhikevich.org/publications/whichmod.htm

Jupyter Notebook · スター 25 個
AllenInstituteNeuroML
Example files to test interaction between models developed at the Allen Brain Institute and NeuroML

HTML · スター 17 個
Documentation
Updated documentation for the Open Source Brain platform using Jupyter Book

Python · スター 13 個
osb-model-validation
Tools for automated model validation in OpenSourceBrain projects

XSLT · スター 9 個
Brunel2000
Sparsely connected spiking neuron network from Brunel 2000

Python · スター 6 個
ACnet2
Primary Auditory Cortex model by Dave Beeman

XSLT · スター 4 個
PyNNShowcase
A repository for testing interactions/conversions between NeuroML & PyNN

Python · スター 4 個
NetPyNEShowcase
NetPyNE & NeuroML interactions

Python · スター 4 個
SolinasEtAl-GolgiCell
GitHub repository for an OSB project containing a cerebellar Golgi cell based on Solinas et al 2007

XSLT · スター 2 個
VogelsSprekelerEtAl2011
Network from Vogels et al, Science 2011

Python · スター 1 個
NEURONShowcase
Examples of how to convert NEURON to & from NeuroML

NMODL · スター 1 個
HindmarshRose1984
HindmarshRose 1984 cell model

Python · スター 0 個

初心者向けすべて

オープンすべて

Remove pin on numpy once PyNN 0.12 used オープン

難易度 1/5 1時間未満初心者へのやさしさ 72/100

OpenSourceBrain/Brunel2000#13 · 2026年5月19日に作成
Remove pin on numpy once PyNN 0.12 used オープン

難易度 1/5 1時間未満初心者へのやさしさ 82/100

OpenSourceBrain/PyNNShowcase#12 · 2026年5月19日に作成
Check Netpyne step in Guided Tour オープン

T: bug

OpenSourceBrain/Documentation#49 · 担当者 1 名 · 2025年7月15日に作成
Investigate handling of ExplicitInputs in the NetPyNE importer オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

OpenSourceBrain/NetPyNEShowcase#13 · 2024年12月19日に作成
Update autogen オープン

bug enhancement

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#119 · 2024年4月11日に作成
Document new git-sparse-checkout usage オープン

C: content T: enhancement V: OSBv2

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 30/100

OpenSourceBrain/Documentation#46 · 2024年1月17日に作成
Rename example from "Regular" to "Bursting" or "RegularBursting" オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/HindmarshRose1984#11 · コメント 1 件 · 2023年11月7日に作成
Have a section saying "why not collab" or "why not binder"? オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 35/100

OpenSourceBrain/Documentation#35 · 2023年7月15日に作成
Make a new release オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#52 · リアクション 1 件 · 2023年1月25日に作成
Update CI to test different NEURON versions, and all available GH arches オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/NEURONShowcase#4 · 2022年10月14日に作成
parse mod channel files directly to neuroml オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 15/100

OpenSourceBrain/NEURONShowcase#2 · コメント 2 件 · 2022年8月25日に作成
Why is the group apic used in the fitting data but not present in the cell? オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#29 · コメント 4 件 · 2022年7月21日に作成
Test pipeline NetPyNE-> NeuroML-> other simulators... オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 30/100

OpenSourceBrain/NetPyNEShowcase#2 · リアクション 2 件 · 2022年5月10日に作成
Redo FAQ document オープン

C: content T: enhancement V: OSBv1 V: OSBv2

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

OpenSourceBrain/Documentation#16 · 2022年1月24日に作成
Add page on publication/citing OSB オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/Documentation#15 · 2021年11月30日に作成
Add omv tests on Octave, PyNN_Brian2, NEST on 3.9 (when working on GHA) オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#12 · 2021年11月29日に作成
Add test on numba script オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#11 · 2021年11月29日に作成
Add new page listing what standard libraries we include, and how to request others オープン

C: content P: low T: enhancement V: OSBv2

OpenSourceBrain/Documentation#11 · コメント 3 件 · 担当者 1 名 · 2021年10月26日に作成
Set up custom CSS オープン

C: theme P: medium T: enhancement

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/Documentation#2 · コメント 1 件 · 2021年5月3日に作成
Do not silently start downloading missing bits assuming installation in hard-coded default locations オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#74 · コメント 2 件 · 2021年1月20日に作成
Adding license info オープン

難易度 2/5 1〜3時間初心者へのやさしさ 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#10 · 2018年12月17日に作成
Parsing included NML files オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#8 · 2017年11月11日に作成
Recursive creation of directories when writing files オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#7 · 2017年11月10日に作成
izhikevich2004.py failing with PyNN 0.9.0 & NEST 2.10.0 オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#6 · コメント 6 件 · 2017年5月31日に作成
Add metadata to detailed cell models オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 45/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#5 · 2016年12月20日に作成
Finalise GLIFs オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#4 · 2016年5月10日に作成
Why is external concentration of ca2 1mM not 2mM? オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#8 · コメント 4 件 · 2016年1月14日に作成
architecture dependent backends オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#64 · 2015年11月19日に作成
Correct handling of seeds オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/Brunel2000#3 · 2015年11月12日に作成
Change TABLE settings for mod files to cover wider voltage range オープン

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#4 · 担当者 1 名 · 2015年10月27日に作成
Compare mod channel implementations & NeuroML2 versions オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#3 · 2015年10月26日に作成
Check neuroConstruct project simulation configurations are producing figures オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#2 · 2015年10月26日に作成
Add more figures from paper to NEURON script オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#1 · コメント 1 件 · 2015年10月26日に作成
Check why Ca_HVA mod file doesn't use Q10 scaling オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#2 · 2015年10月7日に作成
"proper" rewrite オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 20/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#54 · 2014年12月29日に作成
add conda recipes for omv engines オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#53 · 2014年12月29日に作成
update schemas and implement omt validation オープン

bug

OpenSourceBrain/osb-model-validation#42 · 担当者 1 名 · 2014年9月23日に作成
serialize the tallyman オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 20/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#41 · 2014年9月22日に作成
Add documentation for mep / omt elements オープン

難易度 3/5 1〜2日初心者へのやさしさ 38/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#28 · 2014年6月18日に作成
Create a libNeuroML based "pure NeuroML" script to create full 48x48 network オープン

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/ACnet2#4 · 2014年6月17日に作成
Add a Jython based script to the nC project to recreate 48x48 network オープン

enhancement

OpenSourceBrain/ACnet2#3 · 担当者 1 名 · 2014年6月17日に作成
Add Simulation configuration to neuroConstruct project with basic network settings オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

OpenSourceBrain/ACnet2#2 · コメント 1 件 · 2014年6月17日に作成
Add support for querying info from NeuroML オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 30/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#27 · コメント 1 件 · 2014年6月17日に作成
add support for tagged releases オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#22 · コメント 1 件 · 2014年6月3日に作成
add engine version spec オープン

enhancement

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#7 · 2014年4月28日に作成
Add bound checks for activation variables, concentrations オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#6 · コメント 2 件 · 2014年4月28日に作成
add frequency analyzer オープン

enhancement

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 20/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#4 · コメント 1 件 · 2014年4月23日に作成
add unit parsing オープン

enhancement

難易度 5/5 1週間以上初心者へのやさしさ 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#3 · コメント 1 件 · 2014年4月23日に作成
Make single value to scale population size オープン

難易度 4/5 3〜5日初心者へのやさしさ 35/100

OpenSourceBrain/VogelsSprekelerEtAl2011#2 · 2013年8月2日に作成
Modify population specifications to define 8000 e & 2000 i オープン

OpenSourceBrain/VogelsSprekelerEtAl2011#1 · コメント 2 件 · 担当者 1 名 · 2013年8月2日に作成

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