Proprietario

OpenSourceBrain

12 repository indicizzati · Vedi su GitHub

IzhikevichModel
GitHub repository for an OSB project for model from http://izhikevich.org/publications/whichmod.htm

Jupyter Notebook · 25 stelle
AllenInstituteNeuroML
Example files to test interaction between models developed at the Allen Brain Institute and NeuroML

HTML · 17 stelle
Documentation
Updated documentation for the Open Source Brain platform using Jupyter Book

Python · 13 stelle
osb-model-validation
Tools for automated model validation in OpenSourceBrain projects

XSLT · 9 stelle
Brunel2000
Sparsely connected spiking neuron network from Brunel 2000

Python · 6 stelle
ACnet2
Primary Auditory Cortex model by Dave Beeman

XSLT · 4 stelle
PyNNShowcase
A repository for testing interactions/conversions between NeuroML & PyNN

Python · 4 stelle
NetPyNEShowcase
NetPyNE & NeuroML interactions

Python · 4 stelle
SolinasEtAl-GolgiCell
GitHub repository for an OSB project containing a cerebellar Golgi cell based on Solinas et al 2007

XSLT · 2 stelle
VogelsSprekelerEtAl2011
Network from Vogels et al, Science 2011

Python · 1 stella
NEURONShowcase
Examples of how to convert NEURON to & from NeuroML

NMODL · 1 stella
HindmarshRose1984
HindmarshRose 1984 cell model

Python · 0 stelle

Adatte ai principianti Tutto

Aperta Tutte

Remove pin on numpy once PyNN 0.12 used Aperta

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 72/100

OpenSourceBrain/Brunel2000#13 · Aperta il 19/5/2026
Remove pin on numpy once PyNN 0.12 used Aperta

Difficoltà 1/5 Meno di un'ora Idoneità per principianti 82/100

OpenSourceBrain/PyNNShowcase#12 · Aperta il 19/5/2026
Check Netpyne step in Guided Tour Aperta

T: bug

OpenSourceBrain/Documentation#49 · 1 assegnatario · Aperta il 15/7/2025
Investigate handling of ExplicitInputs in the NetPyNE importer Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

OpenSourceBrain/NetPyNEShowcase#13 · Aperta il 19/12/2024
Update autogen Aperta

bug enhancement

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#119 · Aperta il 11/4/2024
Document new git-sparse-checkout usage Aperta

C: content T: enhancement V: OSBv2

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 30/100

OpenSourceBrain/Documentation#46 · Aperta il 17/1/2024
Rename example from "Regular" to "Bursting" or "RegularBursting" Aperta

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/HindmarshRose1984#11 · 1 commento · Aperta il 7/11/2023
Have a section saying "why not collab" or "why not binder"? Aperta

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100

OpenSourceBrain/Documentation#35 · Aperta il 15/7/2023
Make a new release Aperta

enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#52 · 1 reazione · Aperta il 25/1/2023
Update CI to test different NEURON versions, and all available GH arches Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/NEURONShowcase#4 · Aperta il 14/10/2022
parse mod channel files directly to neuroml Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 15/100

OpenSourceBrain/NEURONShowcase#2 · 2 commenti · Aperta il 25/8/2022
Why is the group apic used in the fitting data but not present in the cell? Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#29 · 4 commenti · Aperta il 21/7/2022
Test pipeline NetPyNE-> NeuroML-> other simulators... Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

OpenSourceBrain/NetPyNEShowcase#2 · 2 reazioni · Aperta il 10/5/2022
Redo FAQ document Aperta

C: content T: enhancement V: OSBv1 V: OSBv2

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

OpenSourceBrain/Documentation#16 · Aperta il 24/1/2022
Add page on publication/citing OSB Aperta

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/Documentation#15 · Aperta il 30/11/2021
Add omv tests on Octave, PyNN_Brian2, NEST on 3.9 (when working on GHA) Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#12 · Aperta il 29/11/2021
Add test on numba script Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#11 · Aperta il 29/11/2021
Add new page listing what standard libraries we include, and how to request others Aperta

C: content P: low T: enhancement V: OSBv2

OpenSourceBrain/Documentation#11 · 3 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 26/10/2021
Set up custom CSS Aperta

C: theme P: medium T: enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/Documentation#2 · 1 commento · Aperta il 3/5/2021
Do not silently start downloading missing bits assuming installation in hard-coded default locations Aperta

enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#74 · 2 commenti · Aperta il 20/1/2021
Adding license info Aperta

Difficoltà 2/5 1-3 ore Idoneità per principianti 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#10 · Aperta il 17/12/2018
Parsing included NML files Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#8 · Aperta il 11/11/2017
Recursive creation of directories when writing files Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#7 · Aperta il 10/11/2017
izhikevich2004.py failing with PyNN 0.9.0 & NEST 2.10.0 Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#6 · 6 commenti · Aperta il 31/5/2017
Add metadata to detailed cell models Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 45/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#5 · Aperta il 20/12/2016
Finalise GLIFs Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#4 · Aperta il 10/5/2016
Why is external concentration of ca2 1mM not 2mM? Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#8 · 4 commenti · Aperta il 14/1/2016
architecture dependent backends Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#64 · Aperta il 19/11/2015
Correct handling of seeds Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/Brunel2000#3 · Aperta il 12/11/2015
Change TABLE settings for mod files to cover wider voltage range Aperta

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#4 · 1 assegnatario · Aperta il 27/10/2015
Compare mod channel implementations & NeuroML2 versions Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#3 · Aperta il 26/10/2015
Check neuroConstruct project simulation configurations are producing figures Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#2 · Aperta il 26/10/2015
Add more figures from paper to NEURON script Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#1 · 1 commento · Aperta il 26/10/2015
Check why Ca_HVA mod file doesn't use Q10 scaling Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#2 · Aperta il 7/10/2015
"proper" rewrite Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#54 · Aperta il 29/12/2014
add conda recipes for omv engines Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#53 · Aperta il 29/12/2014
update schemas and implement omt validation Aperta

bug

OpenSourceBrain/osb-model-validation#42 · 1 assegnatario · Aperta il 23/9/2014
serialize the tallyman Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#41 · Aperta il 22/9/2014
Add documentation for mep / omt elements Aperta

Difficoltà 3/5 1-2 giorni Idoneità per principianti 38/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#28 · Aperta il 18/6/2014
Create a libNeuroML based "pure NeuroML" script to create full 48x48 network Aperta

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/ACnet2#4 · Aperta il 17/6/2014
Add a Jython based script to the nC project to recreate 48x48 network Aperta

enhancement

OpenSourceBrain/ACnet2#3 · 1 assegnatario · Aperta il 17/6/2014
Add Simulation configuration to neuroConstruct project with basic network settings Aperta

enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

OpenSourceBrain/ACnet2#2 · 1 commento · Aperta il 17/6/2014
Add support for querying info from NeuroML Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 30/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#27 · 1 commento · Aperta il 17/6/2014
add support for tagged releases Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#22 · 1 commento · Aperta il 3/6/2014
add engine version spec Aperta

enhancement

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#7 · Aperta il 28/4/2014
Add bound checks for activation variables, concentrations Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#6 · 2 commenti · Aperta il 28/4/2014
add frequency analyzer Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 20/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#4 · 1 commento · Aperta il 23/4/2014
add unit parsing Aperta

enhancement

Difficoltà 5/5 Più di una settimana Idoneità per principianti 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#3 · 1 commento · Aperta il 23/4/2014
Make single value to scale population size Aperta

Difficoltà 4/5 3-5 giorni Idoneità per principianti 35/100

OpenSourceBrain/VogelsSprekelerEtAl2011#2 · Aperta il 2/8/2013
Modify population specifications to define 8000 e & 2000 i Aperta

OpenSourceBrain/VogelsSprekelerEtAl2011#1 · 2 commenti · 1 assegnatario · Aperta il 2/8/2013

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