Propietario

OpenSourceBrain

12 repositorios indexados · Ver en GitHub

IzhikevichModel
GitHub repository for an OSB project for model from http://izhikevich.org/publications/whichmod.htm

Jupyter Notebook · 25 estrellas
AllenInstituteNeuroML
Example files to test interaction between models developed at the Allen Brain Institute and NeuroML

HTML · 17 estrellas
Documentation
Updated documentation for the Open Source Brain platform using Jupyter Book

Python · 13 estrellas
osb-model-validation
Tools for automated model validation in OpenSourceBrain projects

XSLT · 9 estrellas
Brunel2000
Sparsely connected spiking neuron network from Brunel 2000

Python · 6 estrellas
ACnet2
Primary Auditory Cortex model by Dave Beeman

XSLT · 4 estrellas
PyNNShowcase
A repository for testing interactions/conversions between NeuroML & PyNN

Python · 4 estrellas
NetPyNEShowcase
NetPyNE & NeuroML interactions

Python · 4 estrellas
SolinasEtAl-GolgiCell
GitHub repository for an OSB project containing a cerebellar Golgi cell based on Solinas et al 2007

XSLT · 2 estrellas
VogelsSprekelerEtAl2011
Network from Vogels et al, Science 2011

Python · 1 estrella
NEURONShowcase
Examples of how to convert NEURON to & from NeuroML

NMODL · 1 estrella
HindmarshRose1984
HindmarshRose 1984 cell model

Python · 0 estrellas

Para principiantes Todo

Abierto Todos

Remove pin on numpy once PyNN 0.12 used Abierto

Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 72/100

OpenSourceBrain/Brunel2000#13 · Abierto el 19/5/2026
Remove pin on numpy once PyNN 0.12 used Abierto

Dificultad 1/5 Menos de una hora Aptitud para principiantes 82/100

OpenSourceBrain/PyNNShowcase#12 · Abierto el 19/5/2026
Check Netpyne step in Guided Tour Abierto

T: bug

OpenSourceBrain/Documentation#49 · 1 asignado · Abierto el 15/7/2025
Investigate handling of ExplicitInputs in the NetPyNE importer Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

OpenSourceBrain/NetPyNEShowcase#13 · Abierto el 19/12/2024
Update autogen Abierto

bug enhancement

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#119 · Abierto el 11/4/2024
Document new git-sparse-checkout usage Abierto

C: content T: enhancement V: OSBv2

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 30/100

OpenSourceBrain/Documentation#46 · Abierto el 17/1/2024
Rename example from "Regular" to "Bursting" or "RegularBursting" Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/HindmarshRose1984#11 · 1 comentario · Abierto el 7/11/2023
Have a section saying "why not collab" or "why not binder"? Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

OpenSourceBrain/Documentation#35 · Abierto el 15/7/2023
Make a new release Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#52 · 1 reacción · Abierto el 25/1/2023
Update CI to test different NEURON versions, and all available GH arches Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/NEURONShowcase#4 · Abierto el 14/10/2022
parse mod channel files directly to neuroml Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 15/100

OpenSourceBrain/NEURONShowcase#2 · 2 comentarios · Abierto el 25/8/2022
Why is the group apic used in the fitting data but not present in the cell? Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#29 · 4 comentarios · Abierto el 21/7/2022
Test pipeline NetPyNE-> NeuroML-> other simulators... Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

OpenSourceBrain/NetPyNEShowcase#2 · 2 reacciones · Abierto el 10/5/2022
Redo FAQ document Abierto

C: content T: enhancement V: OSBv1 V: OSBv2

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

OpenSourceBrain/Documentation#16 · Abierto el 24/1/2022
Add page on publication/citing OSB Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/Documentation#15 · Abierto el 30/11/2021
Add omv tests on Octave, PyNN_Brian2, NEST on 3.9 (when working on GHA) Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#12 · Abierto el 29/11/2021
Add test on numba script Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#11 · Abierto el 29/11/2021
Add new page listing what standard libraries we include, and how to request others Abierto

C: content P: low T: enhancement V: OSBv2

OpenSourceBrain/Documentation#11 · 3 comentarios · 1 asignado · Abierto el 26/10/2021
Set up custom CSS Abierto

C: theme P: medium T: enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/Documentation#2 · 1 comentario · Abierto el 3/5/2021
Do not silently start downloading missing bits assuming installation in hard-coded default locations Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#74 · 2 comentarios · Abierto el 20/1/2021
Adding license info Abierto

Dificultad 2/5 1-3 horas Aptitud para principiantes 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#10 · Abierto el 17/12/2018
Parsing included NML files Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#8 · Abierto el 11/11/2017
Recursive creation of directories when writing files Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#7 · Abierto el 10/11/2017
izhikevich2004.py failing with PyNN 0.9.0 & NEST 2.10.0 Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#6 · 6 comentarios · Abierto el 31/5/2017
Add metadata to detailed cell models Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 45/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#5 · Abierto el 20/12/2016
Finalise GLIFs Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#4 · Abierto el 10/5/2016
Why is external concentration of ca2 1mM not 2mM? Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#8 · 4 comentarios · Abierto el 14/1/2016
architecture dependent backends Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#64 · Abierto el 19/11/2015
Correct handling of seeds Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/Brunel2000#3 · Abierto el 12/11/2015
Change TABLE settings for mod files to cover wider voltage range Abierto

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#4 · 1 asignado · Abierto el 27/10/2015
Compare mod channel implementations & NeuroML2 versions Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#3 · Abierto el 26/10/2015
Check neuroConstruct project simulation configurations are producing figures Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#2 · Abierto el 26/10/2015
Add more figures from paper to NEURON script Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#1 · 1 comentario · Abierto el 26/10/2015
Check why Ca_HVA mod file doesn't use Q10 scaling Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#2 · Abierto el 7/10/2015
"proper" rewrite Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#54 · Abierto el 29/12/2014
add conda recipes for omv engines Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#53 · Abierto el 29/12/2014
update schemas and implement omt validation Abierto

bug

OpenSourceBrain/osb-model-validation#42 · 1 asignado · Abierto el 23/9/2014
serialize the tallyman Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#41 · Abierto el 22/9/2014
Add documentation for mep / omt elements Abierto

Dificultad 3/5 1-2 días Aptitud para principiantes 38/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#28 · Abierto el 18/6/2014
Create a libNeuroML based "pure NeuroML" script to create full 48x48 network Abierto

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/ACnet2#4 · Abierto el 17/6/2014
Add a Jython based script to the nC project to recreate 48x48 network Abierto

enhancement

OpenSourceBrain/ACnet2#3 · 1 asignado · Abierto el 17/6/2014
Add Simulation configuration to neuroConstruct project with basic network settings Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

OpenSourceBrain/ACnet2#2 · 1 comentario · Abierto el 17/6/2014
Add support for querying info from NeuroML Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 30/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#27 · 1 comentario · Abierto el 17/6/2014
add support for tagged releases Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#22 · 1 comentario · Abierto el 3/6/2014
add engine version spec Abierto

enhancement

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#7 · Abierto el 28/4/2014
Add bound checks for activation variables, concentrations Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#6 · 2 comentarios · Abierto el 28/4/2014
add frequency analyzer Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 20/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#4 · 1 comentario · Abierto el 23/4/2014
add unit parsing Abierto

enhancement

Dificultad 5/5 Más de una semana Aptitud para principiantes 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#3 · 1 comentario · Abierto el 23/4/2014
Make single value to scale population size Abierto

Dificultad 4/5 3-5 días Aptitud para principiantes 35/100

OpenSourceBrain/VogelsSprekelerEtAl2011#2 · Abierto el 2/8/2013
Modify population specifications to define 8000 e & 2000 i Abierto

OpenSourceBrain/VogelsSprekelerEtAl2011#1 · 2 comentarios · 1 asignado · Abierto el 2/8/2013

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