Proprietário

OpenSourceBrain

12 repositórios indexados · Ver no GitHub

IzhikevichModel
GitHub repository for an OSB project for model from http://izhikevich.org/publications/whichmod.htm

Jupyter Notebook · 25 estrelas
AllenInstituteNeuroML
Example files to test interaction between models developed at the Allen Brain Institute and NeuroML

HTML · 17 estrelas
Documentation
Updated documentation for the Open Source Brain platform using Jupyter Book

Python · 13 estrelas
osb-model-validation
Tools for automated model validation in OpenSourceBrain projects

XSLT · 9 estrelas
Brunel2000
Sparsely connected spiking neuron network from Brunel 2000

Python · 6 estrelas
ACnet2
Primary Auditory Cortex model by Dave Beeman

XSLT · 4 estrelas
PyNNShowcase
A repository for testing interactions/conversions between NeuroML & PyNN

Python · 4 estrelas
NetPyNEShowcase
NetPyNE & NeuroML interactions

Python · 4 estrelas
SolinasEtAl-GolgiCell
GitHub repository for an OSB project containing a cerebellar Golgi cell based on Solinas et al 2007

XSLT · 2 estrelas
VogelsSprekelerEtAl2011
Network from Vogels et al, Science 2011

Python · 1 estrela
NEURONShowcase
Examples of how to convert NEURON to & from NeuroML

NMODL · 1 estrela
HindmarshRose1984
HindmarshRose 1984 cell model

Python · 0 estrelas

Para iniciantes Tudo

Abertas Todas

Remove pin on numpy once PyNN 0.12 used Aberta

Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 72/100

OpenSourceBrain/Brunel2000#13 · Aberta em 19/5/2026
Remove pin on numpy once PyNN 0.12 used Aberta

Dificuldade 1/5 Menos de uma hora Facilidade para iniciantes 82/100

OpenSourceBrain/PyNNShowcase#12 · Aberta em 19/5/2026
Check Netpyne step in Guided Tour Aberta

T: bug

OpenSourceBrain/Documentation#49 · 1 responsável · Aberta em 15/7/2025
Investigate handling of ExplicitInputs in the NetPyNE importer Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

OpenSourceBrain/NetPyNEShowcase#13 · Aberta em 19/12/2024
Update autogen Aberta

bug enhancement

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#119 · Aberta em 11/4/2024
Document new git-sparse-checkout usage Aberta

C: content T: enhancement V: OSBv2

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 30/100

OpenSourceBrain/Documentation#46 · Aberta em 17/1/2024
Rename example from "Regular" to "Bursting" or "RegularBursting" Aberta

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/HindmarshRose1984#11 · 1 comentário · Aberta em 7/11/2023
Have a section saying "why not collab" or "why not binder"? Aberta

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 35/100

OpenSourceBrain/Documentation#35 · Aberta em 15/7/2023
Make a new release Aberta

enhancement

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#52 · 1 reação · Aberta em 25/1/2023
Update CI to test different NEURON versions, and all available GH arches Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/NEURONShowcase#4 · Aberta em 14/10/2022
parse mod channel files directly to neuroml Aberta

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 15/100

OpenSourceBrain/NEURONShowcase#2 · 2 comentários · Aberta em 25/8/2022
Why is the group apic used in the fitting data but not present in the cell? Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#29 · 4 comentários · Aberta em 21/7/2022
Test pipeline NetPyNE-> NeuroML-> other simulators... Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 30/100

OpenSourceBrain/NetPyNEShowcase#2 · 2 reações · Aberta em 10/5/2022
Redo FAQ document Aberta

C: content T: enhancement V: OSBv1 V: OSBv2

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

OpenSourceBrain/Documentation#16 · Aberta em 24/1/2022
Add page on publication/citing OSB Aberta

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/Documentation#15 · Aberta em 30/11/2021
Add omv tests on Octave, PyNN_Brian2, NEST on 3.9 (when working on GHA) Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#12 · Aberta em 29/11/2021
Add test on numba script Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#11 · Aberta em 29/11/2021
Add new page listing what standard libraries we include, and how to request others Aberta

C: content P: low T: enhancement V: OSBv2

OpenSourceBrain/Documentation#11 · 3 comentários · 1 responsável · Aberta em 26/10/2021
Set up custom CSS Aberta

C: theme P: medium T: enhancement

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/Documentation#2 · 1 comentário · Aberta em 3/5/2021
Do not silently start downloading missing bits assuming installation in hard-coded default locations Aberta

enhancement

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#74 · 2 comentários · Aberta em 20/1/2021
Adding license info Aberta

Dificuldade 2/5 1-3 horas Facilidade para iniciantes 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#10 · Aberta em 17/12/2018
Parsing included NML files Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#8 · Aberta em 11/11/2017
Recursive creation of directories when writing files Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#7 · Aberta em 10/11/2017
izhikevich2004.py failing with PyNN 0.9.0 & NEST 2.10.0 Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/IzhikevichModel#6 · 6 comentários · Aberta em 31/5/2017
Add metadata to detailed cell models Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 45/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#5 · Aberta em 20/12/2016
Finalise GLIFs Aberta

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#4 · Aberta em 10/5/2016
Why is external concentration of ca2 1mM not 2mM? Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#8 · 4 comentários · Aberta em 14/1/2016
architecture dependent backends Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#64 · Aberta em 19/11/2015
Correct handling of seeds Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/Brunel2000#3 · Aberta em 12/11/2015
Change TABLE settings for mod files to cover wider voltage range Aberta

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#4 · 1 responsável · Aberta em 27/10/2015
Compare mod channel implementations & NeuroML2 versions Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#3 · Aberta em 26/10/2015
Check neuroConstruct project simulation configurations are producing figures Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#2 · Aberta em 26/10/2015
Add more figures from paper to NEURON script Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

OpenSourceBrain/SolinasEtAl-GolgiCell#1 · 1 comentário · Aberta em 26/10/2015
Check why Ca_HVA mod file doesn't use Q10 scaling Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/AllenInstituteNeuroML#2 · Aberta em 7/10/2015
"proper" rewrite Aberta

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 20/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#54 · Aberta em 29/12/2014
add conda recipes for omv engines Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 35/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#53 · Aberta em 29/12/2014
update schemas and implement omt validation Aberta

bug

OpenSourceBrain/osb-model-validation#42 · 1 responsável · Aberta em 23/9/2014
serialize the tallyman Aberta

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 20/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#41 · Aberta em 22/9/2014
Add documentation for mep / omt elements Aberta

Dificuldade 3/5 1-2 dias Facilidade para iniciantes 38/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#28 · Aberta em 18/6/2014
Create a libNeuroML based "pure NeuroML" script to create full 48x48 network Aberta

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/ACnet2#4 · Aberta em 17/6/2014
Add a Jython based script to the nC project to recreate 48x48 network Aberta

enhancement

OpenSourceBrain/ACnet2#3 · 1 responsável · Aberta em 17/6/2014
Add Simulation configuration to neuroConstruct project with basic network settings Aberta

enhancement

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

OpenSourceBrain/ACnet2#2 · 1 comentário · Aberta em 17/6/2014
Add support for querying info from NeuroML Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 30/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#27 · 1 comentário · Aberta em 17/6/2014
add support for tagged releases Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#22 · 1 comentário · Aberta em 3/6/2014
add engine version spec Aberta

enhancement

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#7 · Aberta em 28/4/2014
Add bound checks for activation variables, concentrations Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#6 · 2 comentários · Aberta em 28/4/2014
add frequency analyzer Aberta

enhancement

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 20/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#4 · 1 comentário · Aberta em 23/4/2014
add unit parsing Aberta

enhancement

Dificuldade 5/5 Mais de uma semana Facilidade para iniciantes 25/100

OpenSourceBrain/osb-model-validation#3 · 1 comentário · Aberta em 23/4/2014
Make single value to scale population size Aberta

Dificuldade 4/5 3-5 dias Facilidade para iniciantes 35/100

OpenSourceBrain/VogelsSprekelerEtAl2011#2 · Aberta em 2/8/2013
Modify population specifications to define 8000 e & 2000 i Aberta

OpenSourceBrain/VogelsSprekelerEtAl2011#1 · 2 comentários · 1 responsável · Aberta em 2/8/2013

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