Custom delayed operations
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評估
研究方向
先閱讀 showtree 和 .rec_showtree 方法,然後追蹤 getArrayElement 如何處理 DelayedOp 子類別。使用 DelayedAffineSeed 和 DelayedTranslateSeed 重現該範例,包括對暫時的 Zarr 陣列執行子集操作。完成的標準是:包含 DelayedOp 的外部類別能夠參與所要求的延遲操作檢查或存取流程,且不會出現回報的缺少方法錯誤。
由索引模型根據 Issue 內容生成。
描述
Dear @hpages,
I am working on devising lazy image transformations for https://github.com/HelenaLC/SpatialData/issues/162.
I was wondering if it is possible to use showtree or .rec_showtree methods (or similar methods) for external classes that facilitate delayed operations.
I have tried below, but it requires me to define additional methods for these classes that contain DelayedOp:
setClass(
"DelayedAffineSeed",
contains = "DelayedOp",
slots = c(
seed = "ANY",
dim = "integer",
dimnames = "list",
m = "matrix",
axes = "character",
filter = "character",
bg.col = "character",
antialias = "logical",
trace = "logical"
)
)
setClass(
"DelayedTranslateSeed",
contains = "DelayedOp",
slots = c(
seed = "ANY",
dim = "integer",
dimnames = "list",
shift = "numeric",
axes = "character"
)
)
# save as zarr
td <- tempfile(fileext = ".zarr")
delayed_img <- writeZarrArray(x = EBImage::imageData(img), zarr_path = td)
# affine
rotated_delayed_img <- lazy_affine(delayed_img, m = m, filter = "bilinear")
# translate
translate_delayed_img <- lazy_translate(rotated_delayed_img, shift = c(100,200))
# subset
subset_delayed_img <- translate_delayed_img[100:200, 100:200]
> subset_delayed_img@seed
101x101 double: Subset
└─ 1024x512 double: DelayedTranslateSeed object
Error: unable to find an inherited method for function ‘getArrayElement’ for signature ‘x = "DelayedTranslateSeed"’
- 主要語言
- R
- 星號
- 29
- 分支
- 12
- PR 合併指標
- 30 天內沒有已合併 PR
環境準備
這個專案沒有提供開發容器、Dockerfile 或貢獻指南,環境需要你自己搭建:先看它的 README,通用步驟見我們的新手貢獻指南。
從這裡開始
- 先讀完整個 Issue,再讀專案的貢獻指南。
- 在 Issue 下留言說明你要接手 —— 這能避免兩個人做同樣的事。
- Fork 儲存庫,在一個分支上完成修改。
- 送出 Pull Request,並在描述裡引用這個 Issue 編號。
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