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Conversion to dgCMatrix Causes Segmentation Fault

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評估

難度
4/5
預估耗時
3-5 天
新手友好度
38/100
Issue 類型
缺陷
描述清晰度
需要釐清
活躍度
活躍
技術堆疊
r
領域
data

研究方向

未指定原始檔案或測試。首先使用回報的維度重現從 DelayedMatrix 到 dgCMatrix 的轉換,然後追蹤轉換進入點,並記錄相關的 R 與套件版本。完成的標準是:在此情況下轉換不再發生 segfault,且有一個回歸測試涵蓋該情況。

由索引模型根據 Issue 內容生成。

描述

dim(database)
    109578 2389155
class(counts(database))
    "DelayedMatrix"

After about four hours.

assay(database, "counts") <- as(assay(database, "counts"), "dgCMatrix")
     *** caught segfault ***
    address 0x7fc394337000, cause 'invalid permissions'
主要語言
R
星號
29
分支
12
PR 合併指標
30 天內沒有已合併 PR

貢獻指南

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從這裡開始

  1. 先讀完整個 Issue,再讀專案的貢獻指南。
  2. 在 Issue 下留言說明你要接手 —— 這能避免兩個人做同樣的事。
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