Spike ins normalization
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 5/5
- Thời gian dự kiến
- Hơn một tuần
- Mức phù hợp với người mới
- 20/100
- Loại issue
- Tính năng
- Độ rõ ràng
- Cần làm rõ
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Lĩnh vực
- bioinformatics
Hướng nghiên cứu
Không có tệp, bài kiểm thử hoặc điểm vào nào được nêu. Hãy bắt đầu bằng việc xem xét các tùy chọn chuẩn hóa hiện tại và tài liệu của pipeline nf-core/chipseq để xác định liệu chuẩn hóa spike-in có được hỗ trợ hay không. Làm rõ liệu kết quả mong đợi là hướng dẫn sử dụng hay chức năng mới; công việc được xem là hoàn tất khi có hướng dẫn sử dụng được tài liệu hóa hoặc phạm vi triển khai đã được thống nhất.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
Description of feature
Hi nf-core team,
first of all thanks for the amazing work!
I was wondering if the pipeline already takes in consideration the spike ins and in that case how to use it.
If this function in not implemented yet, it is possible to implement it?
Thanks in advance
Emanuel
- Ngôn ngữ chính
- Nextflow
- Star
- 245
- Fork
- 184
- Merge trung bình
- 6 phút
- Pull request đã merge (30 ngày)
- 1
Chuẩn bị môi trường
Khởi chạy dev container của dự án ngay trên trình duyệt, bằng tài khoản GitHub của bạn.
- Không có Dockerfile hay tệp Docker Compose
- Có mẫu pull request
- Đọc hướng dẫn đóng góp
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của nf-core/chipseq
-
MACS3 is reporting that 100 paired reads are needed, even when single end data is used as inputĐang mởbug
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
-
enhancement
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 48/100
-
bug
Độ khó 3/5 1-2 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
-
enhancement improve-behaviour
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 38/100
Tất cả issue của nf-core/chipseq
Issue tương tự
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 72/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
protocol-revision
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 73/100
-
New term request
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
monarch-initiative/mondo#10796 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 85/100
-
update module: SAWFISH/JOINTCALLĐang mởupdate module
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày