Hacktoberfest 2026: những issue maintainer đã đánh dấu cho tháng Mười, đang mở và phù hợp người mới. Xem issue Hacktoberfest

ICD-10-CM codes captured and not captured in charlson.sql

Đang mở
  • Có gì không ổn?
#2,017 3 bình luận 0 reaction 0 người được giao Xem trên GitHub

@acnimma đang làm issue này rồi.

Từ ngày 12/7/2026.

  • #2043 của @acnimma — đang mở
  • #2142 của @Chessing234 — đang mở

Đánh giá

Độ khó
4/5
Thời gian dự kiến
3-5 ngày
Mức phù hợp với người mới
45/100
Loại issue
Lỗi
Độ rõ ràng
Khá rõ ràng
Mức độ hoạt động
Ít trao đổi
Công nghệ
sql
Lĩnh vực
databases

Hướng nghiên cứu

Bắt đầu với mimic-iv/concepts/comorbidity/charlson.sql quanh dòng 305 và so sánh các ánh xạ ICD-10-CM trong đó với định nghĩa của Quan et al. (2005) được trích dẫn trong issue. Xác định C4A, C7A và C7B nên được phân loại như thế nào, sau đó cập nhật ánh xạ để SQL nhất quán với quyết định đó và rà soát các mã bị ảnh hưởng.

Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.

Mô tả

ICD-10-CM have three categories which are not part of the WHO ICD-10 and as such are not defined in Quan et.al (2005)

  • C4A: Merkel cell carcinoma
  • C7A: Malignant neuroendocrine tumors
  • C7B: Secondary neuroendocrine tumors

One of the lines in the SQL for mapping ICD-10 to malignant cancer has a possible positive unexpected side effect

https://github.com/MIT-LCP/mimic-code/blob/57069783095e7770e66ea97da264c0200078ddbf/mimic-iv/concepts/comorbidity/charlson.sql#L305

This will map C4A codes to malignant cancer. That seems conceptually okay but it opens the door for what to do with C7A and C7B codes.

If C4A is included in malignant cancer then shouldn't C7A codes?

Should C4A be excluded to be consistent with Quan et.al (2005)?

I think Merkel cells are part of the skin and since Quan et.al (2005) defines "any malignancy, including lymphoma and leukemia, except malignant neoplasm of skin" that C4A should be excluded?

Cancer is not my area of expertise, I honest have no idea. This is more of question of being consistent with the publication.

Ngôn ngữ chính
Jupyter Notebook
Star
3.4k
Fork
1.7k
Không có pull request nào được merge trong 30 ngày

Chuẩn bị môi trường

Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.

Bắt đầu từ đâu

  1. Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
  2. Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
  3. Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
  4. Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.

Issue khác của MIT-LCP/mimic-code

Tất cả issue của MIT-LCP/mimic-code

Issue tương tự

Thêm issue về Databases

Nhận issue mới trong hộp thư của bạn

Bản tóm tắt ngắn những issue GitHub phù hợp với người mới.