ICD-10-CM codes captured and not captured in charlson.sql
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評価
調査の方向性
mimic-iv/concepts/comorbidity/charlson.sql の305行目付近から始め、そこにある ICD-10-CM のマッピングを、issue で引用されている Quan et al. (2005) の定義と比較してください。C4A、C7A、C7B をどのように分類すべきかを確定し、その決定と SQL が一致するようにマッピングを更新して、影響を受けるコードを確認してください。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
ICD-10-CM have three categories which are not part of the WHO ICD-10 and as such are not defined in Quan et.al (2005)
- C4A: Merkel cell carcinoma
- C7A: Malignant neuroendocrine tumors
- C7B: Secondary neuroendocrine tumors
One of the lines in the SQL for mapping ICD-10 to malignant cancer has a possible positive unexpected side effect
This will map C4A codes to malignant cancer. That seems conceptually okay but it opens the door for what to do with C7A and C7B codes.
If C4A is included in malignant cancer then shouldn't C7A codes?
Should C4A be excluded to be consistent with Quan et.al (2005)?
I think Merkel cells are part of the skin and since Quan et.al (2005) defines "any malignancy, including lymphoma and leukemia, except malignant neoplasm of skin" that C4A should be excluded?
Cancer is not my area of expertise, I honest have no idea. This is more of question of being consistent with the publication.
- 主要言語
- Jupyter Notebook
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- 30日以内にマージされた PR はありません
環境構築
このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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