ICD-10-CM codes captured and not captured in charlson.sql
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Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 45/100
Direzione di ricerca
Inizia da mimic-iv/concepts/comorbidity/charlson.sql intorno alla riga 305 e confronta le relative mappature ICD-10-CM con la definizione di Quan et al. (2005) citata nell’issue. Determina come dovrebbero essere classificati C4A, C7A e C7B, quindi aggiorna la mappatura in modo che SQL sia coerente con tale decisione e verifica i codici interessati.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
ICD-10-CM have three categories which are not part of the WHO ICD-10 and as such are not defined in Quan et.al (2005)
- C4A: Merkel cell carcinoma
- C7A: Malignant neuroendocrine tumors
- C7B: Secondary neuroendocrine tumors
One of the lines in the SQL for mapping ICD-10 to malignant cancer has a possible positive unexpected side effect
This will map C4A codes to malignant cancer. That seems conceptually okay but it opens the door for what to do with C7A and C7B codes.
If C4A is included in malignant cancer then shouldn't C7A codes?
Should C4A be excluded to be consistent with Quan et.al (2005)?
I think Merkel cells are part of the skin and since Quan et.al (2005) defines "any malignancy, including lymphoma and leukemia, except malignant neoplasm of skin" that C4A should be excluded?
Cancer is not my area of expertise, I honest have no idea. This is more of question of being consistent with the publication.
- Lingua principale
- Jupyter Notebook
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- 3.4k
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- 1.7k
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Preparare l'ambiente
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