About multifactor analysis
I maintainer di solito rispondono entro 1 giorno
Nessuno ha ancora preso questa issue.
Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 30/100
- Tipo di issue
- Funzionalità
- Chiarezza
- Da chiarire
- Stato di attività
- Ferma
- Stack tecnologico
- python
- Ambito
- bioinformatics
Direzione di ricerca
Inizia leggendo l'API DeseqDataSet e la documentazione di design-formula per determinare se i metadati continui sono supportati insieme ai fattori categorici. Controlla eventuali esempi o test esistenti per design come “~group+condition”; il lavoro è completato quando il comportamento supportato e la modifica necessaria alla validazione o alla documentazione sono chiaramente stabiliti.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Is your feature request related to a problem? Please describe.
Do know if this works for factors/conditions that with a continuous number like a signature score
Describe the solution you'd like
when doing this, can the condition only be catigorical? is numerical allowed?
dds = DeseqDataSet(
counts=exp_sel,
metadata=dt_info,
design="~group+condition",
refit_cooks=True,
n_cpus=8
)
Thanks.
hfl
- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 763
- Fork
- 90
- Merge medio
- 23m
- PR unite (30g)
- 11
Preparare l'ambiente
- Nessun Dockerfile né file Docker Compose
- Ha un modello di pull request
- Leggi la guida per i contributori
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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