About multifactor analysis
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評価
- 難易度
- 4/5
- 見積もり時間
- 3〜5日
- 初心者へのやさしさ
- 30/100
- issue の種類
- 機能追加
- 明瞭さ
- 説明が足りない
- 活発さ
- 停滞
- 技術スタック
- python
調査の方向性
まず DeseqDataSet API と design-formula のドキュメントを読み、カテゴリカル因子と併せて連続メタデータがサポートされているかを確認します。「~group+condition」のようなデザインについて、既存の例やテストを確認します。サポートされる動作と、必要な検証またはドキュメントの変更が明確に確定すれば完了です。
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Is your feature request related to a problem? Please describe.
Do know if this works for factors/conditions that with a continuous number like a signature score
Describe the solution you'd like
when doing this, can the condition only be catigorical? is numerical allowed?
dds = DeseqDataSet(
counts=exp_sel,
metadata=dt_info,
design="~group+condition",
refit_cooks=True,
n_cpus=8
)
Thanks.
hfl
- 主要言語
- Python
- スター
- 762
- フォーク
- 91
- 平均マージ
- 23分
- マージ済み PR（30日）
- 11
環境構築
- Dockerfile・Docker Compose ファイルなし
- プルリクエストのテンプレートあり
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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