About multifactor analysis
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Evaluación
- Dificultad
- 4/5
- Tiempo estimado
- 3-5 días
- Aptitud para principiantes
- 30/100
- Tipo de issue
- Nueva funcionalidad
- Claridad
- Necesita aclaración
- Estado de actividad
- Estancado
- Stack tecnológico
- python
- Área
- bioinformatics
Línea de trabajo
Comienza leyendo la API de DeseqDataSet y la documentación de design-formula para determinar si se admiten metadatos continuos junto con factores categóricos. Comprueba si existen ejemplos o pruebas para diseños como “~group+condition”; se considera completado cuando el comportamiento admitido y el cambio necesario de validación o documentación estén claramente establecidos.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
Is your feature request related to a problem? Please describe.
Do know if this works for factors/conditions that with a continuous number like a signature score
Describe the solution you'd like
when doing this, can the condition only be catigorical? is numerical allowed?
dds = DeseqDataSet(
counts=exp_sel,
metadata=dt_info,
design="~group+condition",
refit_cooks=True,
n_cpus=8
)
Thanks.
hfl
- Lenguaje dominante
- Python
- Estrellas
- 767
- Forks
- 93
- Merge medio
- 1 min
- PR fusionados (30 d)
- 1
Preparar el entorno
- Sin Dockerfile ni archivo de Docker Compose
- Tiene una plantilla de pull request
- Leer la guía de contribución
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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