add oncoliner tools
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@kubranarci がすでに取り組んでいます。
2024年10月14日 から。
評価
この issue はまだ評価されていません。
説明
Description of feature
ONCOLINER project as a part of EUCANCan has main 3 tools for harmonisation, assessment and improvement of somatic variant callers. All the tools can be used one another or standalone. I am thinking about adding harmonization (which is variant-extractor normalize step) and assessment for benchmarking and last step can also be added merging all the input files given. Could be a nice feature.
https://github.com/EUCANCan/oncoliner/blob/main/modules/oncoliner_assessment/example/example_main.sh
- 主要言語
- Nextflow
- スター
- 53
- フォーク
- 34
- 平均マージ
- 20時間 27分
- マージ済み PR（30日）
- 18
環境構築
このプロジェクトの開発コンテナを、あなたの GitHub アカウントでブラウザ上に起動します。
- Dockerfile・Docker Compose ファイルなし
- プルリクエストのテンプレートあり
- コントリビューションガイドを読む
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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