add oncoliner tools
Los mantenedores suelen responder en 1 día
@kubranarci ya está trabajando en esto.
Desde el 14/10/2024.
Evaluación
Este issue todavía no se ha evaluado.
Descripción
Description of feature
ONCOLINER project as a part of EUCANCan has main 3 tools for harmonisation, assessment and improvement of somatic variant callers. All the tools can be used one another or standalone. I am thinking about adding harmonization (which is variant-extractor normalize step) and assessment for benchmarking and last step can also be added merging all the input files given. Could be a nice feature.
https://github.com/EUCANCan/oncoliner/blob/main/modules/oncoliner_assessment/example/example_main.sh
- Lenguaje dominante
- Nextflow
- Estrellas
- 53
- Forks
- 34
- Merge medio
- 1 d 5 h
- PR fusionados (30 d)
- 20
Preparar el entorno
Inicia el contenedor de desarrollo del proyecto en tu navegador, con tu propia cuenta de GitHub.
- Sin Dockerfile ni archivo de Docker Compose
- Tiene una plantilla de pull request
- Leer la guía de contribución
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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