RF diffusion colab- RMSD
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Evaluación
- Dificultad
- 5/5
- Tiempo estimado
- Más de una semana
- Aptitud para principiantes
- 20/100
- Tipo de issue
- Error
- Claridad
- Necesita aclaración
- Estado de actividad
- Tranquilo
- Stack tecnológico
- jupyter-notebook, python
Línea de trabajo
The report concerns the RFdiffusion online Colab workflow and RMSD or peptide placement, but names no files or tests. Start by reproducing the exposed-hotspot peptide design in the Colab notebook and inspect the generated peptide's distance from the selected sites; done would require identifying the cause or documenting reliable guidance.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
Hello,
I need some help in RF diffusion- colab- online notebook version.
I have tried several times to design peptides for a protein. The problem is even with exposed hotspots, the peptide can’t reach them and appeared very distant. For instance instead of binding at the upper part of the targeted chain it will stay close to the opposite sites . Later. I tried to pick those opposite sites in different runs it is as well stayed distant. Any tips😊?
- Lenguaje dominante
- Python
- Estrellas
- 3.1k
- Forks
- 652
- Métricas de merge de PR
- Sin PR fusionados en 30 d
Preparar el entorno
Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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