RF diffusion colab- RMSD
まだ誰も着手していません。
評価
- 難易度
- 5/5
- 見積もり時間
- 1週間以上
- 初心者へのやさしさ
- 20/100
- issue の種類
- バグ
- 明瞭さ
- 説明が足りない
- 活発さ
- 静か
- 技術スタック
- jupyter-notebook, python
調査の方向性
The report concerns the RFdiffusion online Colab workflow and RMSD or peptide placement, but names no files or tests. Start by reproducing the exposed-hotspot peptide design in the Colab notebook and inspect the generated peptide's distance from the selected sites; done would require identifying the cause or documenting reliable guidance.
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
Hello,
I need some help in RF diffusion- colab- online notebook version.
I have tried several times to design peptides for a protein. The problem is even with exposed hotspots, the peptide can’t reach them and appeared very distant. For instance instead of binding at the upper part of the targeted chain it will stay close to the opposite sites . Later. I tried to pick those opposite sites in different runs it is as well stayed distant. Any tips😊?
- 主要言語
- Python
- スター
- 3.1k
- フォーク
- 650
- PR マージ指標
- 30日以内にマージされた PR はありません
環境構築
このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
RosettaCommons/RFdiffusion のほかの issue
-
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 25/100
RosettaCommons/RFdiffusion#456 · コメント 3 件 ·
-
難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 45/100
RosettaCommons/RFdiffusion#453 · コメント 1 件 ·
-
5070Ti cuda errorオープン
難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100
RosettaCommons/RFdiffusion#444 · コメント 6 件 ·
-
question
難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100
RosettaCommons/RFdiffusion#443 ·
-
難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 25/100
RosettaCommons/RFdiffusion#442 ·
RosettaCommons/RFdiffusion の issue をすべて見る
似ている issue
-
docs pydanty:is-working
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 68/100
pydantic/pydantic-ai#10113 ·
メンテナーはふだん 1 日以内に返信
-
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 77/100
GreedyBear-Project/GreedyBear#1727 ·
メンテナーはふだん 2 日以内に返信
-
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 84/100
ARM-software/CMSIS-DSP#354 ·
-
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 68/100
kiat/codeAssist#391 ·
-
needs triage
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 83/100
darnitdevorg/darnit#587 ·
メンテナーはふだん 1 日以内に返信