RF diffusion colab- RMSD
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 5/5
- Thời gian dự kiến
- Hơn một tuần
- Mức phù hợp với người mới
- 20/100
- Loại issue
- Lỗi
- Độ rõ ràng
- Cần làm rõ
- Mức độ hoạt động
- Ít trao đổi
- Công nghệ
- jupyter-notebook, python
- Lĩnh vực
- bioinformatics, machine-learning
Hướng nghiên cứu
The report concerns the RFdiffusion online Colab workflow and RMSD or peptide placement, but names no files or tests. Start by reproducing the exposed-hotspot peptide design in the Colab notebook and inspect the generated peptide's distance from the selected sites; done would require identifying the cause or documenting reliable guidance.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
Hello,
I need some help in RF diffusion- colab- online notebook version.
I have tried several times to design peptides for a protein. The problem is even with exposed hotspots, the peptide can’t reach them and appeared very distant. For instance instead of binding at the upper part of the targeted chain it will stay close to the opposite sites . Later. I tried to pick those opposite sites in different runs it is as well stayed distant. Any tips😊?
- Ngôn ngữ chính
- Python
- Star
- 3.1k
- Fork
- 650
- Chỉ số merge pull request
- Không có pull request nào được merge trong 30 ngày
Chuẩn bị môi trường
Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của RosettaCommons/RFdiffusion
-
Designing a symmetric binderĐang mở
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
RosettaCommons/RFdiffusion#456 · 3 bình luận ·
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
RosettaCommons/RFdiffusion#453 · 1 bình luận ·
-
5070Ti cuda errorĐang mở
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
RosettaCommons/RFdiffusion#444 · 6 bình luận ·
-
Deformation of coordinate spaceĐang mởquestion
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100
RosettaCommons/RFdiffusion#443 ·
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100
RosettaCommons/RFdiffusion#442 ·
Tất cả issue của RosettaCommons/RFdiffusion
Issue tương tự
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 74/100
vllm-project/vllm#61131 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
kubernetes-client/python#2735 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
desktop help wanted test
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 78/100
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Broken links found in docsĐang mởdocs pydanty:is-working
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
pydantic/pydantic-ai#10113 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
Tutorial unit test leaks sample data into tutorial doctestCó thể đã có người làm @Gambit-Checkmate đã nhận hôm nay. Đang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 84/100