RF diffusion colab- RMSD
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评估
- 难度
- 5/5
- 预计耗时
- 一周以上
- 新手友好度
- 20/100
- Issue 类型
- 缺陷
- 描述清晰度
- 需要澄清
- 活跃度
- 冷清
- 技术栈
- jupyter-notebook, python
调研方向
The report concerns the RFdiffusion online Colab workflow and RMSD or peptide placement, but names no files or tests. Start by reproducing the exposed-hotspot peptide design in the Colab notebook and inspect the generated peptide's distance from the selected sites; done would require identifying the cause or documenting reliable guidance.
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
Hello,
I need some help in RF diffusion- colab- online notebook version.
I have tried several times to design peptides for a protein. The problem is even with exposed hotspots, the peptide can’t reach them and appeared very distant. For instance instead of binding at the upper part of the targeted chain it will stay close to the opposite sites . Later. I tried to pick those opposite sites in different runs it is as well stayed distant. Any tips😊?
- 主要语言
- Python
- 星标
- 3.1k
- 派生
- 650
- PR 合并指标
- 30 天内没有已合并 PR
环境准备
这个项目没有提供开发容器、Dockerfile 或贡献指南，环境需要你自己搭建：先看它的 README，通用步骤见我们的新手贡献指南。
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
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