Symmetry number estimations not always accurate
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Evaluación
- Dificultad
- 4/5
- Tiempo estimado
- 3-5 días
- Aptitud para principiantes
- 28/100
Línea de trabajo
Reproduce the ethane example through autotst.species.Conformer.calculate_symmetry_number() and inspect how it calls RMG's symmetry package. Compare the reported C1 result with the expected symmetry number of 6, then investigate whether the current package or an alternative can produce the correct value. Done means the example returns the expected result and the affected behavior is covered by an appropriate check.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
Symmetry numbers calculated using RMG's symmetry package tend to result in incorrect estimations of symmetry numbers. Below is an example of ethane which should have a symmetry number of 6. This issue arose when creating PR #48. Some investigation into alternate packages may remedy this.
In [1]: from autotst.species import Conformer
In [2]: conf = Conformer("CC")
In [3]: conf.calculate_symmetry_number()
symmetry.py:253 write_input_file INFO Symmetry input file written to ./CC.symm
symmetry.py:219 parse INFO Point group: C1
Out[3]: 1
- Lenguaje dominante
- Python
- Estrellas
- 51
- Forks
- 19
- Métricas de merge de PR
- Sin PR fusionados en 30 d
Preparar el entorno
Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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