Symmetry number estimations not always accurate
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Valutazione
- Difficoltà
- 4/5
- Tempo stimato
- 3-5 giorni
- Idoneità per principianti
- 28/100
Direzione di ricerca
Reproduce the ethane example through autotst.species.Conformer.calculate_symmetry_number() and inspect how it calls RMG's symmetry package. Compare the reported C1 result with the expected symmetry number of 6, then investigate whether the current package or an alternative can produce the correct value. Done means the example returns the expected result and the affected behavior is covered by an appropriate check.
Scritto dal modello di indicizzazione a partire dal testo della issue.
Descrizione
Symmetry numbers calculated using RMG's symmetry package tend to result in incorrect estimations of symmetry numbers. Below is an example of ethane which should have a symmetry number of 6. This issue arose when creating PR #48. Some investigation into alternate packages may remedy this.
In [1]: from autotst.species import Conformer
In [2]: conf = Conformer("CC")
In [3]: conf.calculate_symmetry_number()
symmetry.py:253 write_input_file INFO Symmetry input file written to ./CC.symm
symmetry.py:219 parse INFO Point group: C1
Out[3]: 1
- Lingua principale
- Python
- Stelle
- 51
- Fork
- 19
- Metriche di merge delle PR
- Nessuna PR unita negli ultimi 30g
Preparare l'ambiente
Questo progetto non fornisce container di sviluppo, Dockerfile né guida per i contributori, quindi l'ambiente è a tuo carico: parti dal suo README e consulta la nostra guida al primo contributo per i passaggi generali.
Come iniziare
- Leggi tutta la issue e poi la guida ai contributi del progetto.
- Commenta sulla issue per dire che te ne occupi tu — evita che due persone facciano lo stesso lavoro.
- Fai un fork del repository e lavora su un branch.
- Apri una pull request che faccia riferimento al numero della issue.
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