Symmetry number estimations not always accurate
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评估
调研方向
Reproduce the ethane example through autotst.species.Conformer.calculate_symmetry_number() and inspect how it calls RMG's symmetry package. Compare the reported C1 result with the expected symmetry number of 6, then investigate whether the current package or an alternative can produce the correct value. Done means the example returns the expected result and the affected behavior is covered by an appropriate check.
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
Symmetry numbers calculated using RMG's symmetry package tend to result in incorrect estimations of symmetry numbers. Below is an example of ethane which should have a symmetry number of 6. This issue arose when creating PR #48. Some investigation into alternate packages may remedy this.
In [1]: from autotst.species import Conformer
In [2]: conf = Conformer("CC")
In [3]: conf.calculate_symmetry_number()
symmetry.py:253 write_input_file INFO Symmetry input file written to ./CC.symm
symmetry.py:219 parse INFO Point group: C1
Out[3]: 1
- 主要语言
- Python
- 星标
- 51
- 派生
- 19
- PR 合并指标
- 30 天内没有已合并 PR
环境准备
这个项目没有提供开发容器、Dockerfile 或贡献指南,环境需要你自己搭建:先看它的 README,通用步骤见我们的新手贡献指南。
从这里开始
- 先读完整个 Issue,再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库,在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request,并在描述里引用这个 Issue 编号。
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