Builder Clean: handle crowded complexes (e.g. Fe with six PPh3)
Dieses Issue hat noch niemand übernommen.
Bewertung
- Schwierigkeit
- 5/5
- Geschätzter Aufwand
- Über eine Woche
- Anfängerfreundlichkeit
- 35/100
Rechercherichtung
The issue identifies Builder Clean and the Ligands library but gives no file or test paths. Start by locating the Clean implementation and its existing optimization tests, then check how ligand attachment handles a crowded octahedral Fe complex. Done means Clean resolves severe overlaps in transition-metal complexes such as Fe with six PPh3 ligands.
Vom Indexierungsmodell aus dem Issue-Text verfasst.
Beschreibung
From the 9.0.0 release test (Linux, 2026-10-12). After attaching several bulky ligands from the Ligands library (e.g. PPh3 on an octahedral Fe), Clean cannot resolve the overlap: atoms stay on top of each other. Clean needs a force field / optimiser that handles transition-metal complexes and severe steric overlap (e.g. UFF with a staged relaxation: rigid-ligand rotations about the M–L bond first, then full relaxation).
- Vorherrschende Sprache
- C
- Sterne
- 10
- Forks
- 8
- Ø Merge
- 21 Min.
- Gemergte PRs (30 T.)
- 1
Entwicklungsumgebung
Dieses Projekt bietet weder Dev-Container noch Dockerfile noch Beitragsleitfaden – die Einrichtung liegt bei Ihnen. Beginnen Sie mit der README; die allgemeinen Schritte stehen in unserem Leitfaden für den ersten Beitrag.
Erste Schritte
- Lesen Sie das ganze Issue und danach den Beitragsleitfaden des Projekts.
- Schreiben Sie ins Issue, dass Sie es übernehmen — das erspart doppelte Arbeit.
- Forken Sie das Repository und arbeiten Sie in einem Branch.
- Öffnen Sie einen Pull Request, der die Issue-Nummer nennt.
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