Builder Clean: handle crowded complexes (e.g. Fe with six PPh3)
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Avaliação
- Dificuldade
- 5/5
- Tempo estimado
- Mais de uma semana
- Facilidade para iniciantes
- 35/100
Direção de pesquisa
The issue identifies Builder Clean and the Ligands library but gives no file or test paths. Start by locating the Clean implementation and its existing optimization tests, then check how ligand attachment handles a crowded octahedral Fe complex. Done means Clean resolves severe overlaps in transition-metal complexes such as Fe with six PPh3 ligands.
Escrita pelo modelo de indexação a partir do texto da issue.
Descrição
From the 9.0.0 release test (Linux, 2026-10-12). After attaching several bulky ligands from the Ligands library (e.g. PPh3 on an octahedral Fe), Clean cannot resolve the overlap: atoms stay on top of each other. Clean needs a force field / optimiser that handles transition-metal complexes and severe steric overlap (e.g. UFF with a staged relaxation: rigid-ligand rotations about the M–L bond first, then full relaxation).
- Linguagem predominante
- C
- Estrelas
- 10
- Forks
- 8
- Merge médio
- 21min
- PRs com merge (30d)
- 1
Preparar o ambiente
Este projeto não oferece contêiner de desenvolvimento, Dockerfile nem guia de contribuição, então a configuração fica por sua conta: comece pelo README e veja nosso guia da primeira contribuição para os passos gerais.
Primeiros passos
- Leia a issue inteira e depois o guia de contribuição do projeto.
- Comente na issue dizendo que vai assumir — evita que duas pessoas façam o mesmo trabalho.
- Faça um fork do repositório e trabalhe em uma branch.
- Abra um pull request que referencie o número da issue.
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