Builder Clean: handle crowded complexes (e.g. Fe with six PPh3)
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評価
調査の方向性
The issue identifies Builder Clean and the Ligands library but gives no file or test paths. Start by locating the Clean implementation and its existing optimization tests, then check how ligand attachment handles a crowded octahedral Fe complex. Done means Clean resolves severe overlaps in transition-metal complexes such as Fe with six PPh3 ligands.
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
From the 9.0.0 release test (Linux, 2026-10-12). After attaching several bulky ligands from the Ligands library (e.g. PPh3 on an octahedral Fe), Clean cannot resolve the overlap: atoms stay on top of each other. Clean needs a force field / optimiser that handles transition-metal complexes and severe steric overlap (e.g. UFF with a staged relaxation: rigid-ligand rotations about the M–L bond first, then full relaxation).
- 主要言語
- C
- スター
- 10
- フォーク
- 8
- 平均マージ
- 21分
- マージ済み PR（30日）
- 1
環境構築
このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
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