Builder Clean: handle crowded complexes (e.g. Fe with six PPh3)
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Evaluación
- Dificultad
- 5/5
- Tiempo estimado
- Más de una semana
- Aptitud para principiantes
- 35/100
Línea de trabajo
The issue identifies Builder Clean and the Ligands library but gives no file or test paths. Start by locating the Clean implementation and its existing optimization tests, then check how ligand attachment handles a crowded octahedral Fe complex. Done means Clean resolves severe overlaps in transition-metal complexes such as Fe with six PPh3 ligands.
Escrito por el modelo de indexación a partir del texto del issue.
Descripción
From the 9.0.0 release test (Linux, 2026-10-12). After attaching several bulky ligands from the Ligands library (e.g. PPh3 on an octahedral Fe), Clean cannot resolve the overlap: atoms stay on top of each other. Clean needs a force field / optimiser that handles transition-metal complexes and severe steric overlap (e.g. UFF with a staged relaxation: rigid-ligand rotations about the M–L bond first, then full relaxation).
- Lenguaje dominante
- C
- Estrellas
- 10
- Forks
- 8
- Merge medio
- 21 min
- PR fusionados (30 d)
- 1
Preparar el entorno
Este proyecto no incluye contenedor de desarrollo, Dockerfile ni guía de contribución, así que la configuración corre por tu cuenta: empieza por su README y consulta nuestra guía para la primera contribución para los pasos generales.
Primeros pasos
- Lee el issue completo y luego la guía de contribución del proyecto.
- Comenta en el issue que vas a ocuparte — evita que dos personas hagan lo mismo.
- Haz un fork del repositorio y trabaja en una rama.
- Abre un pull request que haga referencia al número del issue.
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