Builder Clean: handle crowded complexes (e.g. Fe with six PPh3)
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Évaluation
- Difficulté
- 5/5
- Temps estimé
- Plus d'une semaine
- Accessibilité débutants
- 35/100
Piste de recherche
The issue identifies Builder Clean and the Ligands library but gives no file or test paths. Start by locating the Clean implementation and its existing optimization tests, then check how ligand attachment handles a crowded octahedral Fe complex. Done means Clean resolves severe overlaps in transition-metal complexes such as Fe with six PPh3 ligands.
Rédigé par le modèle d'indexation à partir du texte de l'issue.
Description
From the 9.0.0 release test (Linux, 2026-10-12). After attaching several bulky ligands from the Ligands library (e.g. PPh3 on an octahedral Fe), Clean cannot resolve the overlap: atoms stay on top of each other. Clean needs a force field / optimiser that handles transition-metal complexes and severe steric overlap (e.g. UFF with a staged relaxation: rigid-ligand rotations about the M–L bond first, then full relaxation).
- Langage dominant
- C
- Étoiles
- 10
- Forks
- 8
- Merge moyen
- 21 min
- PR mergées (30 j)
- 1
Préparer son environnement
Ce projet ne fournit ni conteneur de développement, ni Dockerfile, ni guide de contribution : l'installation est à votre charge. Commencez par son README, et consultez notre guide de la première contribution pour les étapes générales.
Par où commencer
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