nf-core/methylseq
Methylation (Bisulfite-Sequencing) analysis pipeline using Bismark/bwa-meth + MethylDackel or bwa-mem + rastair
nf-core/methylseq 对新手友好吗？
近期外部贡献者向 nf-core/methylseq 提交的 PR 还不够多，暂时无法判断它们被合并的比例。 目前有 3 个适合新手的 issue 开放。
- 星标
- 201
- 派生
- 182
- 开放的新手 issue
- 3
- 已索引 issue
- 28
- 平均合并
- 45 分钟
- 30 天内合并 PR
- 1
如何为 nf-core/methylseq 做贡献
- 先读贡献指南：它说明了维护者希望如何提出、测试和评审改动。
- 项目自带 dev container：在 Codespaces 中打开，在浏览器里直接得到一个能用的开发环境。
- 读一下行为准则：它同样适用于 issue 和 PR，而不只是聊天。
- 从下方 3 个开放的新手友好 issue 中选一个，开始之前先留言说明你想认领它。
可能已有人在做的 issue 排在最后。 全部按时间排序
-
bwa-mem3 support未关闭enhancement
难度 5/5 一周以上 新手友好度 20/100
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Add UMI support未关闭enhancement
难度 5/5 一周以上 新手友好度 15/100
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enhancement
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 48/100
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enhancement
难度 5/5 一周以上 新手友好度 35/100
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Calling variants with rastair in the TAPS branch可能重新可做 @eduard-watchmaker 于 103 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭enhancement
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bug
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 72/100
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bug
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
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enhancement
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 45/100
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speed issues未关闭
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 30/100
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bug
难度 1/5 1 小时以内 新手友好度 58/100
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enhancement
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
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bug
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 48/100
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bug
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 45/100
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难度 4/5 3-5 天 新手友好度 42/100
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bug
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 68/100
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bug
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 45/100
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bug
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 45/100
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难度 1/5 1 小时以内 新手友好度 68/100
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enhancement
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
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bug
难度 2/5 1-3 小时 新手友好度 38/100
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bug
难度 3/5 1-2 天 新手友好度 35/100
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enhancement
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 35/100
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Specify additional "genomes" of spike-in controls for downstream calculation of bisulfite conversion efficiency可能重新可做 @PanosProv 于 713 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭enhancement
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Support for NuGEN Ovation RRBS可能重新可做 @jma1991 于 984 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭stale
难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100
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Add `rastair`可能重新可做 @eduard-watchmaker 于 391 天前认领，目前没有进行中的 PR。 未关闭enhancement
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dsl2 enhancement
难度 5/5 一周以上 新手友好度 25/100
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Complexity curve未关闭question stale
难度 4/5 3-5 天 新手友好度 20/100
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Add SNP calling未关闭enhancement
难度 5/5 一周以上 新手友好度 30/100