Biolinkml Performance Issue
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评估
- 难度
- 4/5
- 预计耗时
- 3-5 天
- 新手友好度
- 35/100
- Issue 类型
- 缺陷
- 描述清晰度
- 基本清楚
- 活跃度
- 停滞
- 技术栈
- python
- 领域
- performance
调研方向
Start by locating the biolink-model evaluator and the handling of the shown CLOSED pattern. Reproduce the slow behavior with the simple test mentioned in the issue, then trace how that pattern leads to combinatorial growth. Done means the evaluator completes the affected case without the reported slowdown; the issue does not name a test file or implementation entry point.
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
The biolinkml biolink-model evaluator takes a loooong time to complete, even in a simple test. This is due to the pattern:
<C> CLOSED {
( $<C_tes> ( &<B_tes> ;
rdf:type [ <t1> ] ?
) ;
rdf:type [ <t2> ]
)
}
which, in certain situations, can cause the evaulator to take off on a combinatorial explosion
- 主要语言
- Jupyter Notebook
- 星标
- 29
- 派生
- 16
- 平均合并
- 20 小时 57 分钟
- 30 天内合并 PR
- 9
环境准备
这个项目没有提供开发容器、Dockerfile 或贡献指南，环境需要你自己搭建：先看它的 README，通用步骤见我们的新手贡献指南。
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
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