Biolinkml Performance Issue
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評估
- 難度
- 4/5
- 預估耗時
- 3-5 天
- 新手友好度
- 35/100
- Issue 類型
- 缺陷
- 描述清晰度
- 基本清楚
- 活躍度
- 停滯
- 技術堆疊
- python
- 領域
- performance
研究方向
Start by locating the biolink-model evaluator and the handling of the shown CLOSED pattern. Reproduce the slow behavior with the simple test mentioned in the issue, then trace how that pattern leads to combinatorial growth. Done means the evaluator completes the affected case without the reported slowdown; the issue does not name a test file or implementation entry point.
由索引模型根據 Issue 內容生成。
描述
The biolinkml biolink-model evaluator takes a loooong time to complete, even in a simple test. This is due to the pattern:
<C> CLOSED {
( $<C_tes> ( &<B_tes> ;
rdf:type [ <t1> ] ?
) ;
rdf:type [ <t2> ]
)
}
which, in certain situations, can cause the evaulator to take off on a combinatorial explosion
- 主要語言
- Jupyter Notebook
- 星號
- 29
- 分支
- 16
- 平均合併
- 20 小時 57 分鐘
- 30 天內合併 PR
- 9
環境準備
這個專案沒有提供開發容器、Dockerfile 或貢獻指南，環境需要你自己搭建：先看它的 README，通用步驟見我們的新手貢獻指南。
從這裡開始
- 先讀完整個 Issue，再讀專案的貢獻指南。
- 在 Issue 下留言說明你要接手 —— 這能避免兩個人做同樣的事。
- Fork 儲存庫，在一個分支上完成修改。
- 送出 Pull Request，並在描述裡引用這個 Issue 編號。
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