Biolinkml Performance Issue
まだ誰も着手していません。
評価
- 難易度
- 4/5
- 見積もり時間
- 3〜5日
- 初心者へのやさしさ
- 35/100
- issue の種類
- バグ
- 明瞭さ
- おおむね明確
- 活発さ
- 停滞
- 技術スタック
- python
- 領域
- performance
調査の方向性
Start by locating the biolink-model evaluator and the handling of the shown CLOSED pattern. Reproduce the slow behavior with the simple test mentioned in the issue, then trace how that pattern leads to combinatorial growth. Done means the evaluator completes the affected case without the reported slowdown; the issue does not name a test file or implementation entry point.
索引モデルが issue の本文から書いたものです。
説明
The biolinkml biolink-model evaluator takes a loooong time to complete, even in a simple test. This is due to the pattern:
<C> CLOSED {
( $<C_tes> ( &<B_tes> ;
rdf:type [ <t1> ] ?
) ;
rdf:type [ <t2> ]
)
}
which, in certain situations, can cause the evaulator to take off on a combinatorial explosion
- 主要言語
- Jupyter Notebook
- スター
- 29
- フォーク
- 16
- 平均マージ
- 20時間 57分
- マージ済み PR（30日）
- 9
環境構築
このプロジェクトには開発コンテナ、Dockerfile、コントリビューションガイドがありません。まず README を読み、一般的な手順ははじめてのコントリビューションガイドを参照してください。
はじめの一歩
- issue を最後まで読み、次にプロジェクトのコントリビューションガイドを読みます。
- 着手することを issue にコメントします — 二人が同じ作業をするのを防げます。
- リポジトリをフォークし、ブランチを切って変更します。
- issue 番号を参照したプルリクエストを送ります。
linkml/PyShEx のほかの issue
-
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 48/100
-
難易度 5/5 1週間以上 初心者へのやさしさ 35/100
-
Unicode outside BMPオープン
難易度 4/5 3〜5日 初心者へのやさしさ 35/100
-
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 48/100
-
難易度 3/5 1〜2日 初心者へのやさしさ 35/100
似ている issue
-
domain/usage p2
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 83/100
-
idea-scout idea:251
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 75/100
jeanibarz/agent-notebook#251 ·
メンテナーはふだん 1 日以内に返信
-
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 66/100
ZcashFoundation/zebra#12324 ·
メンテナーはふだん 1 日以内に返信
-
help wanted performance
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 84/100
blixvip/MotionClone#12 ·
-
follow-up needs-triage S3: minor
難易度 2/5 1〜3時間 初心者へのやさしさ 84/100
manaflow-ai/cmux#37111 · コメント 1 件 ·
メンテナーはふだん 1 日以内に返信