Picking Hotspot
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评估
- 难度
- 4/5
- 预计耗时
- 3-5 天
- 新手友好度
- 25/100
- Issue 类型
- 文档
- 描述清晰度
- 需要澄清
- 活跃度
- 停滞
- 技术栈
- python
调研方向
Start with the Design Binder hotspot definition quoted in the issue and the target complex obtained from PDB. Determine how hotspot selection should be handled when the target is bound to a small molecule, then document the applicable procedure and its completion criteria. No source file or test is named, so project structure and existing guidance will need to be located first.
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
Hello community, In the Design Binder feature of RFdiffusion, the authors have stated that “define an interface hotspot residues as any residue on the target chain that is within 10 Angstrom Cbeta-Cbeta distance of the binder chain.” As I understand, their “binder” here is protein/peptide. However, my target (I got it from PBD) is in a complex with a small molecule. So, in my case, how can I pick hotspots?
- 主要语言
- Python
- 星标
- 3.1k
- 派生
- 652
- PR 合并指标
- 30 天内没有已合并 PR
环境准备
这个项目没有提供开发容器、Dockerfile 或贡献指南，环境需要你自己搭建：先看它的 README，通用步骤见我们的新手贡献指南。
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
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