Picking Hotspot
Chưa có ai nhận issue này.
Đánh giá
- Độ khó
- 4/5
- Thời gian dự kiến
- 3-5 ngày
- Mức phù hợp với người mới
- 25/100
- Loại issue
- Tài liệu
- Độ rõ ràng
- Cần làm rõ
- Mức độ hoạt động
- Đình trệ
- Công nghệ
- python
- Lĩnh vực
- machine-learning
Hướng nghiên cứu
Start with the Design Binder hotspot definition quoted in the issue and the target complex obtained from PDB. Determine how hotspot selection should be handled when the target is bound to a small molecule, then document the applicable procedure and its completion criteria. No source file or test is named, so project structure and existing guidance will need to be located first.
Do mô hình lập chỉ mục viết ra từ nội dung của issue.
Mô tả
Hello community, In the Design Binder feature of RFdiffusion, the authors have stated that “define an interface hotspot residues as any residue on the target chain that is within 10 Angstrom Cbeta-Cbeta distance of the binder chain.” As I understand, their “binder” here is protein/peptide. However, my target (I got it from PBD) is in a complex with a small molecule. So, in my case, how can I pick hotspots?
- Ngôn ngữ chính
- Python
- Star
- 3.1k
- Fork
- 652
- Chỉ số merge pull request
- Không có pull request nào được merge trong 30 ngày
Chuẩn bị môi trường
Dự án này không cung cấp dev container, Dockerfile hay hướng dẫn đóng góp, nên bạn cần tự thiết lập môi trường: hãy bắt đầu từ README và xem hướng dẫn đóng góp lần đầu của chúng tôi để biết các bước chung.
Bắt đầu từ đâu
- Đọc hết issue, rồi đọc hướng dẫn đóng góp của dự án.
- Bình luận trên issue rằng bạn sẽ nhận — tránh hai người làm cùng một việc.
- Fork repository và làm thay đổi trên một nhánh.
- Mở pull request có tham chiếu số hiệu của issue.
Issue khác của RosettaCommons/RFdiffusion
-
Designing a symmetric binderĐang mở
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 25/100
RosettaCommons/RFdiffusion#456 · 3 bình luận ·
-
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 45/100
RosettaCommons/RFdiffusion#453 · 1 bình luận ·
-
RF diffusion colab- RMSDĐang mở
Độ khó 5/5 Hơn một tuần Mức phù hợp với người mới 20/100
RosettaCommons/RFdiffusion#449 ·
-
5070Ti cuda errorĐang mở
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 35/100
RosettaCommons/RFdiffusion#444 · 6 bình luận ·
-
Deformation of coordinate spaceĐang mởquestion
Độ khó 4/5 3-5 ngày Mức phù hợp với người mới 25/100
RosettaCommons/RFdiffusion#443 ·
Tất cả issue của RosettaCommons/RFdiffusion
Issue tương tự
-
bug
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 68/100
jbacalso24/mimry#291 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
good first issue
Độ khó 2/5 Dưới một giờ Mức phù hợp với người mới 82/100
eli-alvarado/us-watchlist-alerts#14 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày
-
from-review-extraction python severity:nit
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 80/100
LearningCircuit/local-deep-research#7462 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày
-
mermaid_extract.py silently discards single-line state-diagram notes; sequence notes are keptĐang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 82/100
cathrynlavery/diagram-design#441 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 2 ngày
-
[Cleanup] Include the public header in work_split.cppCó thể đã có người làm @blozano-tt đã nhận hôm nay. Đang mở
Độ khó 2/5 1-3 giờ Mức phù hợp với người mới 82/100
tenstorrent/tt-metal#60850 ·
Maintainer thường phản hồi trong vòng 1 ngày