expand Error data is NULL
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评估
- 难度
- 4/5
- 预计耗时
- 3-5 天
- 新手友好度
- 35/100
- Issue 类型
- 缺陷
- 描述清晰度
- 需要澄清
- 活跃度
- 停滞
- 技术栈
- r
调研方向
通过使用 readVcf 读取 af-only-gnomad.hg38.vcf.gz 并调用 expand 来复现失败，然后沿着 .expandGeno 和 .expandAD 跟踪 traceback。当此 gnomAD 文件能够在不出现 NULL-data 错误的情况下展开，同时包示例仍能正常运行时，该 issue 即得到解决。
由索引模型根据 Issue 内容生成。
描述
It doesn't happen with the package's example file but does with Genome Analysis ToolKit's gnomAD allele frequency file.
populationFreq <- readVcf("af-only-gnomad.hg38.vcf.gz")
expand(populationFreq)
Error in array(vec, c(idxlen, xcols, 2L)) :
'data' must be of a vector type, was 'NULL'
> traceback()
6: array(vec, c(idxlen, xcols, 2L))
5: .expandAD(gvarR, length(idx), ncol(x))
4: .expandGeno(x, hdr, elt, idx)
- 主要语言
- R
- 星标
- 32
- 派生
- 21
- PR 合并指标
- 30 天内没有已合并 PR
贡献指南
这个仓库没有索引到贡献指南
从这里开始
- 先读完整个 Issue，再读项目的贡献指南。
- 在 Issue 下留言说明你要接手 —— 这能避免两个人做同样的事。
- Fork 仓库，在一个分支上完成修改。
- 提交 Pull Request，并在描述里引用这个 Issue 编号。
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